More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5953 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2259  AMP-dependent synthetase and ligase  62.19 
 
 		 616 aa  771    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000572274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5953  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 612 aa  1237    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664785  normal  0.0418717 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  74.26 
 
 		 613 aa  932    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.163962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  53.85 
 
 		 608 aa  613  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0692269  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28860  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  42.5 
 
 		 612 aa  487  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7362  AMP-dependent synthetase and ligase  44.3 
 
 		 624 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.942718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4370  AMP-dependent synthetase and ligase  45.96 
 
 		 601 aa  459  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1129  AMP-dependent synthetase and ligase  46.09 
 
 		 597 aa  457  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3508  AMP-dependent synthetase and ligase  43.14 
 
 		 607 aa  428  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2941  AMP-dependent synthetase and ligase  39.23 
 
 		 773 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2937  AMP-dependent synthetase and ligase  40.53 
 
 		 610 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 		 618 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 		 603 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 		 623 aa  351  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  36.15 
 
 		 617 aa  350  3e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  34.7 
 
 		 603 aa  349  8e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  36.33 
 
 		 607 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  34.99 
 
 		 603 aa  345  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 		 626 aa  343  5.999999999999999e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11582  fatty-acid-CoA ligase fadD11  40.79 
 
 		 571 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  36.09 
 
 		 602 aa  340  4e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  33.94 
 
 		 597 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  33.94 
 
 		 597 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  33.94 
 
 		 597 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  35.93 
 
 		 606 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  33.22 
 
 		 594 aa  334  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  35.86 
 
 		 610 aa  334  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  36.84 
 
 		 599 aa  334  3e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  35.36 
 
 		 622 aa  333  5e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  33.9 
 
 		 649 aa  332  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  35.21 
 
 		 622 aa  332  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  35.31 
 
 		 602 aa  330  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  35.76 
 
 		 606 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  34.66 
 
 		 633 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  35.76 
 
 		 606 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 		 602 aa  325  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 		 607 aa  326  1e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  33.56 
 
 		 596 aa  325  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  31.02 
 
 		 607 aa  323  5e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  33.62 
 
 		 612 aa  322  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  33.95 
 
 		 601 aa  320  7e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  35.53 
 
 		 615 aa  319  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  35.55 
 
 		 616 aa  319  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 602 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  34.14 
 
 		 600 aa  318  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 		 602 aa  317  5e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 		 602 aa  317  5e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  33.89 
 
 		 599 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  34.58 
 
 		 604 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  34.58 
 
 		 604 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  34.07 
 
 		 604 aa  313  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  35.32 
 
 		 597 aa  313  9e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 		 609 aa  312  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6820  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 		 653 aa  312  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  35.19 
 
 		 606 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  31.51 
 
 		 610 aa  310  5e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  35.61 
 
 		 591 aa  310  5e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  33.55 
 
 		 605 aa  310  5e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  35.08 
 
 		 597 aa  309  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  33.67 
 
 		 611 aa  308  2.0000000000000002e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  33.22 
 
 		 599 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 		 599 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 		 607 aa  307  3e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  34 
 
 		 615 aa  307  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  31.8 
 
 		 633 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  33.68 
 
 		 613 aa  306  8.000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  34.42 
 
 		 606 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  33.44 
 
 		 611 aa  305  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  32.63 
 
 		 604 aa  304  3.0000000000000004e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  34.28 
 
 		 604 aa  304  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  34.08 
 
 		 600 aa  304  4.0000000000000003e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.54 
 
 		 598 aa  303  7.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  33.17 
 
 		 599 aa  302  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4067  AMP-dependent synthetase and ligase  33.1 
 
 		 603 aa  302  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.675218  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  33.56 
 
 		 606 aa  302  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 		 597 aa  301  3e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 		 601 aa  300  4e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  32.99 
 
 		 602 aa  300  5e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  34.2 
 
 		 606 aa  300  5e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  31.92 
 
 		 605 aa  298  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  33.68 
 
 		 602 aa  297  4e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 		 595 aa  297  5e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1543  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 		 651 aa  296  6e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00460036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.41 
 
 		 610 aa  296  6e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.77 
 
 		 597 aa  296  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  31 
 
 		 600 aa  295  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  32.83 
 
 		 597 aa  295  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 		 609 aa  295  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 602 aa  295  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  31.57 
 
 		 587 aa  295  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  29.43 
 
 		 610 aa  295  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.37 
 
 		 610 aa  294  4e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  33.51 
 
 		 608 aa  294  4e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2750  putative AMP-binding enzyme  29.85 
 
 		 611 aa  293  5e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  31.11 
 
 		 603 aa  292  1e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  29.29 
 
 		 610 aa  291  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 		 612 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  31.89 
 
 		 600 aa  291  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 619 aa  291  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 599 aa  290  4e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>