More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5904 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  100 
 
 
399 aa  780    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  62.54 
 
 
428 aa  363  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  50.75 
 
 
405 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  41.3 
 
 
400 aa  236  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  39.02 
 
 
447 aa  216  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  43.14 
 
 
417 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  42 
 
 
408 aa  207  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  43.89 
 
 
420 aa  206  8e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  39.6 
 
 
422 aa  204  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  44.97 
 
 
410 aa  202  6e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.14 
 
 
394 aa  199  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 
405 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  38.92 
 
 
433 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 
441 aa  192  9e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
439 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.39 
 
 
406 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  42.05 
 
 
478 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  45.28 
 
 
367 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  50 
 
 
392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  39.16 
 
 
402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  41.43 
 
 
397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  36.8 
 
 
430 aa  183  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  37.63 
 
 
392 aa  182  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  44.78 
 
 
407 aa  179  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  45.96 
 
 
441 aa  178  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  49.12 
 
 
406 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  44.67 
 
 
384 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.07 
 
 
398 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 
421 aa  177  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 
394 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  38.19 
 
 
395 aa  176  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  43.87 
 
 
423 aa  176  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  47.14 
 
 
430 aa  176  8e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  35.91 
 
 
439 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  39.84 
 
 
399 aa  173  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  39.29 
 
 
402 aa  172  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.46 
 
 
443 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 
403 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2680  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.01 
 
 
271 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.913052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  41.09 
 
 
442 aa  169  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  43.85 
 
 
395 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  34.47 
 
 
414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  40.36 
 
 
383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
496 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  34.23 
 
 
438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  47.87 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  45.53 
 
 
388 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 
445 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  35.71 
 
 
443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.02 
 
 
386 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
420 aa  163  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1653  histidine kinase  47.28 
 
 
470 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.29 
 
 
400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  42.17 
 
 
380 aa  162  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  42.5 
 
 
378 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.28 
 
 
430 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  42.68 
 
 
372 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  48.36 
 
 
408 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 
392 aa  160  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  34.92 
 
 
393 aa  159  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  35.38 
 
 
402 aa  159  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.39 
 
 
424 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  45.24 
 
 
457 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  39.65 
 
 
421 aa  157  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  40.31 
 
 
407 aa  156  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4052  histidine kinase  42.41 
 
 
385 aa  156  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  45.58 
 
 
372 aa  155  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2823  histidine kinase  35.94 
 
 
413 aa  154  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302112  normal  0.674587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  46.08 
 
 
419 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  36.31 
 
 
462 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  34.48 
 
 
442 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 
391 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
500 aa  150  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  36.34 
 
 
380 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  45.11 
 
 
372 aa  150  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  48.77 
 
 
357 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  37.12 
 
 
399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  43.5 
 
 
384 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4685  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
467 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  43.12 
 
 
382 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  39.39 
 
 
393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  37.07 
 
 
384 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.51 
 
 
357 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  34.38 
 
 
379 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.35 
 
 
379 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.06 
 
 
382 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  38.18 
 
 
380 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.89 
 
 
379 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.51 
 
 
370 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 
398 aa  143  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 
387 aa  142  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.88 
 
 
380 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  36.53 
 
 
408 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  34.86 
 
 
394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  35.57 
 
 
424 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  41.82 
 
 
380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  33.76 
 
 
375 aa  140  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04490  signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 
469 aa  140  6e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  41.94 
 
 
387 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>