103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5903 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  100 
 
 		 295 aa  595  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  76.14 
 
 		 286 aa  421  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  72.59 
 
 		 311 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  64.18 
 
 		 299 aa  353  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  63.81 
 
 		 351 aa  344  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  61.98 
 
 		 303 aa  327  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  62.69 
 
 		 334 aa  318  7e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  60.15 
 
 		 266 aa  318  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  57.63 
 
 		 313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  58.59 
 
 		 297 aa  312  3.9999999999999997e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  61.15 
 
 		 294 aa  311  6.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  60.15 
 
 		 333 aa  309  4e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  58.25 
 
 		 322 aa  305  8.000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  60 
 
 		 303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  55.26 
 
 		 273 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  54.18 
 
 		 280 aa  300  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  59.53 
 
 		 302 aa  297  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  56.64 
 
 		 267 aa  296  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  56.64 
 
 		 284 aa  296  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  60.84 
 
 		 320 aa  293  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  58.66 
 
 		 297 aa  291  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  55.35 
 
 		 304 aa  269  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  54.92 
 
 		 277 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  54.92 
 
 		 277 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  54.92 
 
 		 277 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  54.02 
 
 		 291 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  52.78 
 
 		 323 aa  264  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  52.26 
 
 		 278 aa  255  6e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  52.21 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  45.7 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  39.29 
 
 		 259 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  33.09 
 
 		 276 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  26.98 
 
 		 1019 aa  95.5  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39374  predicted protein  30.8 
 
 		 366 aa  92.8  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4397  hypothetical protein  27.06 
 
 		 615 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.272271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2712  hypothetical protein  28.82 
 
 		 543 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000442298  hitchhiker  0.0000400817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  27.76 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  29.52 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  29.33 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  27.06 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  29.31 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  27.38 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  27.76 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  24.21 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  21.25 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  24.63 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  26.2 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  22.4 
 
 		 1016 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  23.81 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  27.27 
 
 		 1052 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  27.45 
 
 		 387 aa  62.4  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  23.77 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  24.02 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  26.59 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  26.56 
 
 		 1059 aa  57.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  30.57 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  25.27 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  26.09 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  25.98 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  25.98 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  25.88 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  28.02 
 
 		 781 aa  56.2  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  21.56 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  20.08 
 
 		 803 aa  55.1  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  27.06 
 
 		 783 aa  54.7  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  26.24 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  23.86 
 
 		 781 aa  52.4  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1061 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2313  UvrD/REP helicase  25.95 
 
 		 984 aa  51.2  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  29.05 
 
 		 1101 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  29.02 
 
 		 958 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1737  phage NTP-binding protein  22.46 
 
 		 530 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  30.87 
 
 		 1038 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  30.95 
 
 		 984 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  26.84 
 
 		 865 aa  46.6  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  26.94 
 
 		 1051 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  26.94 
 
 		 1051 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  22.94 
 
 		 1048 aa  46.6  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.29 
 
 		 1124 aa  46.6  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  26.81 
 
 		 1051 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  30.82 
 
 		 988 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  30.15 
 
 		 1038 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4407  ATP-dependent nuclease subunit B-like  25.5 
 
 		 1045 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0781  hypothetical protein  43.06 
 
 		 886 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384751  normal  0.165581 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1404  UvrD/REP helicase  26.49 
 
 		 1091 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1422  UvrD/REP helicase  26.49 
 
 		 1091 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.98 
 
 		 957 aa  43.9  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0207  UvrD/REP helicase  24.54 
 
 		 970 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.00182272  decreased coverage  0.0000000525372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0282  hypothetical protein  22.18 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  28.8 
 
 		 1164 aa  43.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  33.53 
 
 		 1123 aa  43.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5053  hypothetical protein  24.81 
 
 		 267 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.609849 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  33.56 
 
 		 962 aa  42.7  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1052 aa  42.7  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  25 
 
 		 1066 aa  42.7  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  26.03 
 
 		 1052 aa  42.7  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  30.12 
 
 		 991 aa  42.7  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  24.51 
 
 		 1062 aa  42.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  28.74 
 
 		 986 aa  42.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  26.17 
 
 		 1055 aa  42.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>