146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5818 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  100 
 
 		 766 aa  1514    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  56.05 
 
 		 748 aa  709    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  50.94 
 
 		 813 aa  629  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  51.11 
 
 		 759 aa  613  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  52.06 
 
 		 726 aa  612  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  51.37 
 
 		 754 aa  609  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  47.4 
 
 		 742 aa  611  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  50.53 
 
 		 741 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  50.59 
 
 		 746 aa  603  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  47.17 
 
 		 742 aa  602  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  49.09 
 
 		 832 aa  599  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  50.91 
 
 		 776 aa  596  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  51.05 
 
 		 786 aa  598  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  47.94 
 
 		 804 aa  587  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  50.39 
 
 		 757 aa  584  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  50.45 
 
 		 767 aa  585  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  46.95 
 
 		 829 aa  574  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  46 
 
 		 902 aa  570  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  48.06 
 
 		 795 aa  571  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  46.44 
 
 		 788 aa  567  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  47.92 
 
 		 874 aa  559  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  46.59 
 
 		 747 aa  555  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  48.89 
 
 		 765 aa  554  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  45.5 
 
 		 732 aa  550  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  45.65 
 
 		 733 aa  545  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  46.96 
 
 		 758 aa  536  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  44.87 
 
 		 735 aa  531  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  46.23 
 
 		 771 aa  532  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  52.85 
 
 		 750 aa  528  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  44.27 
 
 		 734 aa  528  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  41.55 
 
 		 758 aa  514  1e-144  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  45.3 
 
 		 724 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  45.3 
 
 		 724 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  45.17 
 
 		 724 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  43.1 
 
 		 759 aa  503  1e-141  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  43.98 
 
 		 685 aa  473  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.68 
 
 		 691 aa  360  5e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  40.15 
 
 		 693 aa  351  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  37.99 
 
 		 703 aa  348  3e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  39.76 
 
 		 705 aa  338  2.9999999999999997e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  38.91 
 
 		 716 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  34.9 
 
 		 799 aa  321  3.9999999999999996e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  36.49 
 
 		 726 aa  320  5e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  35.22 
 
 		 742 aa  319  2e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  35.26 
 
 		 761 aa  306  9.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  34.99 
 
 		 717 aa  299  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  33.64 
 
 		 715 aa  296  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.51 
 
 		 715 aa  290  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.01 
 
 		 764 aa  288  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.46 
 
 		 732 aa  281  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  32.19 
 
 		 692 aa  280  6e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  36.25 
 
 		 666 aa  273  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  34.38 
 
 		 710 aa  263  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  38.46 
 
 		 706 aa  251  3e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3495  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.47 
 
 		 728 aa  249  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.471615  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  43 
 
 		 659 aa  247  6e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  41.32 
 
 		 724 aa  246  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.86 
 
 		 755 aa  236  1.0000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.39 
 
 		 710 aa  226  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  41.22 
 
 		 672 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.55 
 
 		 705 aa  219  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.45 
 
 		 695 aa  214  4.9999999999999996e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  35.77 
 
 		 719 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  37.11 
 
 		 717 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  38.58 
 
 		 680 aa  198  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  37.39 
 
 		 679 aa  194  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  40.69 
 
 		 684 aa  193  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  27.94 
 
 		 1048 aa  193  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  38.07 
 
 		 695 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.2 
 
 		 670 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.7 
 
 		 645 aa  189  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  36.57 
 
 		 792 aa  188  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  36.98 
 
 		 727 aa  182  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.97 
 
 		 861 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  42.78 
 
 		 716 aa  129  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  37.17 
 
 		 755 aa  130  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  35.75 
 
 		 691 aa  127  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  36.94 
 
 		 706 aa  127  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  35.75 
 
 		 689 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  36.94 
 
 		 706 aa  127  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  35.27 
 
 		 691 aa  126  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  35.27 
 
 		 689 aa  126  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  35.27 
 
 		 691 aa  126  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  35.27 
 
 		 689 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  35.27 
 
 		 689 aa  125  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  35.27 
 
 		 689 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  36.36 
 
 		 689 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  33.89 
 
 		 787 aa  123  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  34.78 
 
 		 689 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  36.7 
 
 		 712 aa  120  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  39.72 
 
 		 763 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  34.78 
 
 		 702 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  37.91 
 
 		 763 aa  118  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1680  superfamily I DNA/RNA helicase  30.84 
 
 		 764 aa  117  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.119697  hitchhiker  0.00309861 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1625  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  32.9 
 
 		 768 aa  117  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  31.82 
 
 		 760 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05840  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.97 
 
 		 698 aa  114  8.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0355773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  34.71 
 
 		 753 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00160  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.52 
 
 		 706 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.805287 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  34.15 
 
 		 785 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>