More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5768 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 239 aa  464  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1480  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 235 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1502  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 235 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1477  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4338  transcriptional regulator, TetR family  44.4 
 
 		 231 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3709  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.168211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0548  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 229 aa  67  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  31.12 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  42.67 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  29.82 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  41.33 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  40.51 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1784  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 198 aa  54.3  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  33.03 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5683  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 189 aa  52.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17527  hitchhiker  0.003772 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 199 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  46.43 
 
 		 197 aa  52.4  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 192 aa  52.4  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 188 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0354  hypothetical protein  36.46 
 
 		 230 aa  52  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0313675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 216 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 202 aa  52  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 193 aa  52  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 206 aa  52  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  39.24 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  35.59 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1121  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.2139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 202 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 203 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0348  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 198 aa  49.7  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  27.91 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0976  regulatory protein TetR  33.85 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00018682  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 219 aa  49.3  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0940  transcriptional regulator  31.73 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00130273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 211 aa  49.3  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 201 aa  49.3  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 197 aa  48.9  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 211 aa  48.9  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 211 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>