More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5736 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
158 aa  322  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  70 
 
 
152 aa  213  7e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  57.79 
 
 
171 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  54.14 
 
 
453 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4517  protein tyrosine phosphatase  49.71 
 
 
196 aa  150  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113878  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0445  protein tyrosine phosphatase  51.83 
 
 
186 aa  149  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  49.38 
 
 
159 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  53.69 
 
 
166 aa  141  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3589  protein tyrosine phosphatase  52.98 
 
 
164 aa  137  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  hitchhiker  0.00146697 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  51.3 
 
 
182 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0078  protein tyrosine phosphatase  48.81 
 
 
178 aa  135  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  49.34 
 
 
164 aa  134  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  49.36 
 
 
160 aa  134  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  51.28 
 
 
160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
160 aa  133  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
160 aa  133  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  49.33 
 
 
161 aa  133  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3277  protein tyrosine phosphatase  48.05 
 
 
171 aa  130  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000374545  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3134  protein tyrosine phosphatase  50.63 
 
 
167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  48.72 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  48.37 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.8 
 
 
160 aa  127  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  50.68 
 
 
154 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  43.87 
 
 
162 aa  126  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  45.7 
 
 
173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  48.72 
 
 
160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  50.68 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  47.59 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  50.68 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  42.14 
 
 
175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0179  protein tyrosine phosphatase  45.03 
 
 
175 aa  125  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  47.77 
 
 
159 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  47.06 
 
 
163 aa  124  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0034  protein tyrosine phosphatase  43.35 
 
 
182 aa  124  8.000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297427  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3711  protein tyrosine phosphatase  45.39 
 
 
187 aa  123  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.742197  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  45.39 
 
 
174 aa  122  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  42.38 
 
 
157 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  49.32 
 
 
175 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  45.03 
 
 
163 aa  121  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  45.27 
 
 
166 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  47.71 
 
 
158 aa  121  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  48.7 
 
 
159 aa  121  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  41.61 
 
 
165 aa  120  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2713  protein tyrosine phosphatase  46.67 
 
 
155 aa  120  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  43.45 
 
 
175 aa  120  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  42.77 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  44.74 
 
 
164 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  46.75 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  48.65 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  44.94 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  45.39 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  45.57 
 
 
164 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  45.57 
 
 
164 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  45.57 
 
 
159 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  45.57 
 
 
159 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  45.57 
 
 
164 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  45.57 
 
 
164 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  45.57 
 
 
164 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  40.38 
 
 
164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12263  phosphotyrosine protein phosphatase ptpA  44.52 
 
 
163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  42.67 
 
 
188 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  45.27 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  50.36 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0095  protein tyrosine phosphatase  43.24 
 
 
173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3634  protein tyrosine phosphatase  42.68 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0875  protein tyrosine phosphatase  50.69 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.897131  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.1 
 
 
154 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  40.38 
 
 
157 aa  114  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  44.97 
 
 
155 aa  114  6.9999999999999995e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  42.58 
 
 
165 aa  114  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  44.16 
 
 
150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00340  protein-tyrosine-phosphatase  43.9 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.662786 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  45.03 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  42.47 
 
 
162 aa  111  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  43.23 
 
 
162 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2307  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.57 
 
 
161 aa  111  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.224234  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1749  protein tyrosine phosphatase  40.38 
 
 
160 aa  112  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  43.05 
 
 
157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1854  protein tyrosine phosphatase  42.67 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  42.31 
 
 
162 aa  111  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.48 
 
 
164 aa  110  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3622  protein tyrosine phosphatase  43.45 
 
 
164 aa  110  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27551  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  42.11 
 
 
158 aa  110  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  46.15 
 
 
158 aa  110  9e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  41.14 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  37.89 
 
 
161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  41.56 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2888  protein tyrosine phosphatase  42.07 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0779863  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4997  protein tyrosine phosphatase  46.05 
 
 
157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00738059  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1888  protein tyrosine phosphatase  41.33 
 
 
160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  43.45 
 
 
154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  46.58 
 
 
158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_004310  BR0083  phosphotyrosine protein phosphatase  41.22 
 
 
201 aa  108  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0559  phosphotyrosine protein phosphatase  44.06 
 
 
155 aa  108  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00747923  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3099  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.76 
 
 
157 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0468905  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3347  protein tyrosine phosphatase  43.51 
 
 
165 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236586  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  37.33 
 
 
163 aa  108  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3358  protein tyrosine phosphatase  43.51 
 
 
165 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603407  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3409  protein tyrosine phosphatase  43.51 
 
 
165 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198502  normal  0.488282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>