63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5648 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5648  hypothetical protein  100 
 
 
518 aa  1011    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  52.55 
 
 
504 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5875  hypothetical protein  44.55 
 
 
543 aa  363  6e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.191888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  36.51 
 
 
1029 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  33.33 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  30.73 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  35.19 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  31.22 
 
 
379 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  31.25 
 
 
246 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  31.48 
 
 
239 aa  69.3  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  31.13 
 
 
279 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  29.82 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  30.28 
 
 
272 aa  67  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  29.86 
 
 
253 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  29.58 
 
 
298 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  38.32 
 
 
12684 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  32.6 
 
 
277 aa  64.3  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  32.87 
 
 
297 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  33.19 
 
 
271 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  35.38 
 
 
243 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  27.15 
 
 
1332 aa  59.3  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  30.33 
 
 
272 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  31.62 
 
 
283 aa  59.3  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  28.24 
 
 
834 aa  58.2  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2394  Fibronectin type III domain protein  30.41 
 
 
580 aa  57.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.374405  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  31.58 
 
 
259 aa  57.4  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  28.88 
 
 
276 aa  57  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2491  Fibronectin type III domain protein  31.33 
 
 
566 aa  56.2  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  30.19 
 
 
294 aa  56.6  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  32.35 
 
 
255 aa  55.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  30.33 
 
 
276 aa  55.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  26.62 
 
 
870 aa  55.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000150479  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1435  putative integral membrane protein  29.61 
 
 
275 aa  55.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.973684  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  27.49 
 
 
292 aa  54.7  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2235  hypothetical protein  32.69 
 
 
255 aa  54.3  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  37.61 
 
 
301 aa  54.3  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  30.95 
 
 
1050 aa  54.3  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  27.32 
 
 
253 aa  53.9  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0101  hypothetical protein  25 
 
 
324 aa  53.5  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.250348 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4807  hypothetical protein  58.49 
 
 
450 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.280649  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  30.89 
 
 
285 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  30.12 
 
 
750 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  32.12 
 
 
254 aa  50.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  28.64 
 
 
278 aa  49.7  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
669 aa  49.7  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.142173  normal  0.0665505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  27.49 
 
 
251 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  27.83 
 
 
256 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0253  hypothetical protein  24.34 
 
 
885 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274245  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  27.22 
 
 
1011 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  32.49 
 
 
278 aa  48.5  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  29.28 
 
 
293 aa  47.4  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1899  hypothetical protein  31.28 
 
 
251 aa  47.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  23.08 
 
 
1406 aa  47  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  33.65 
 
 
271 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  29.35 
 
 
256 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  38.46 
 
 
246 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  38.46 
 
 
246 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  38.46 
 
 
246 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  44.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  25.62 
 
 
308 aa  43.9  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4498  hypothetical protein  29.49 
 
 
272 aa  43.9  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.952254  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3490  hypothetical protein  42.62 
 
 
274 aa  43.5  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3689  hypothetical protein  26.39 
 
 
274 aa  43.5  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>