More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5589 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5589  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 513 aa  1033    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3973  extracellular solute-binding protein family 5  44.51 
 
 		 505 aa  331  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617507  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  37.45 
 
 		 516 aa  288  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0576  extracellular solute-binding protein family 5  35.21 
 
 		 533 aa  273  8.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  38.32 
 
 		 517 aa  270  5e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  38.37 
 
 		 517 aa  269  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0409  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 		 520 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1039  extracellular solute-binding protein family 5  38.06 
 
 		 503 aa  253  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.78614  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2781  extracellular solute-binding protein  31.48 
 
 		 525 aa  249  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3559  extracellular solute-binding protein  36.03 
 
 		 526 aa  249  8e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3332  extracellular solute-binding protein  33.91 
 
 		 517 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3338  extracellular solute-binding protein  33.59 
 
 		 524 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1543  extracellular solute-binding protein family 5  32.28 
 
 		 513 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.397228  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0157  twin-arginine translocation pathway signal  30.77 
 
 		 545 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.695568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2183  extracellular solute-binding protein  30.69 
 
 		 529 aa  227  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0249  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  31.07 
 
 		 545 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5666  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.16 
 
 		 537 aa  223  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2178  extracellular solute-binding protein  30.89 
 
 		 529 aa  222  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246301  normal  0.618007 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1495  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.32 
 
 		 538 aa  220  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.045715  hitchhiker  0.00127227 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6426  extracellular solute-binding protein family 5  30.12 
 
 		 529 aa  220  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6090  extracellular solute-binding protein family 5  31.52 
 
 		 538 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4502  extracellular solute-binding protein family 5  30.33 
 
 		 526 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  31.94 
 
 		 539 aa  218  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3756  putative peptide ABC transporter, substrate- binding protein  35.32 
 
 		 514 aa  217  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279615  normal  0.332846 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4497  extracellular solute-binding protein family 5  29.73 
 
 		 529 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1922  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  29.49 
 
 		 535 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2844  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 		 534 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.922612  normal  0.415189 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6591  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 		 540 aa  213  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.476219 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3074  extracellular solute-binding protein  30.84 
 
 		 536 aa  213  7.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3699  extracellular solute-binding protein  31.1 
 
 		 527 aa  212  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5006  extracellular solute-binding protein family 5  30.08 
 
 		 536 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.264167 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5594  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 535 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459863  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  30.12 
 
 		 518 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5634  extracellular solute-binding protein family 5  32.28 
 
 		 540 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6277  extracellular solute-binding protein  32.68 
 
 		 527 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0281814  normal  0.114415 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6444  twin-arginine translocation pathway signal  32.68 
 
 		 527 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6679  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component  32.68 
 
 		 527 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3524  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  32.6 
 
 		 534 aa  203  7e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.413747  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2187  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 		 519 aa  203  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.843737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3168  extracellular solute-binding protein  32.8 
 
 		 534 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2945  extracellular solute-binding protein  30.93 
 
 		 509 aa  201  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5304  extracellular solute-binding protein family 5  28.32 
 
 		 536 aa  200  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.85757 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6354  extracellular solute-binding protein  32.47 
 
 		 527 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3525  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 535 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6057  extracellular solute-binding protein  32.47 
 
 		 527 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3169  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 535 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.116403 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6274  extracellular solute-binding protein family 5  29.5 
 
 		 511 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0245039 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2843  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 		 535 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3746  extracellular solute-binding protein family 5  29.64 
 
 		 513 aa  195  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2914  extracellular solute-binding protein family 5  29.78 
 
 		 537 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6279  extracellular solute-binding protein family 5  29.88 
 
 		 512 aa  194  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3816  twin-arginine translocation pathway signal  30.24 
 
 		 522 aa  193  6e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.961587  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5072  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 519 aa  191  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  30.58 
 
 		 515 aa  189  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 		 527 aa  189  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6276  extracellular solute-binding protein family 5  30 
 
 		 496 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0695772 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0786  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.39 
 
 		 526 aa  183  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  31 
 
 		 516 aa  180  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4961  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 537 aa  178  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  normal  0.0265573 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.55 
 
 		 510 aa  171  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2105  extracellular solute-binding protein family 5  30.77 
 
 		 538 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0251373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  30.53 
 
 		 516 aa  168  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  30.85 
 
 		 523 aa  167  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  27.32 
 
 		 532 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2078  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 550 aa  159  8e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0155484  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 		 512 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  28.36 
 
 		 510 aa  157  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 		 511 aa  156  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.69 
 
 		 512 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  26.61 
 
 		 502 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.87 
 
 		 513 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26 
 
 		 532 aa  153  8e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.1 
 
 		 534 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 512 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 512 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 512 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 		 510 aa  147  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1749  extracellular solute-binding protein family 5  30.16 
 
 		 538 aa  146  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 535 aa  146  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  27.09 
 
 		 554 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 561 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.47 
 
 		 554 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  28.2 
 
 		 565 aa  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.95 
 
 		 535 aa  144  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  24.64 
 
 		 515 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 515 aa  141  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  28.75 
 
 		 509 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  24.03 
 
 		 527 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  29.33 
 
 		 523 aa  140  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  22.67 
 
 		 521 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  22.67 
 
 		 521 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  22.67 
 
 		 521 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.67 
 
 		 521 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5357  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  26.09 
 
 		 502 aa  139  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0991682  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  22.67 
 
 		 521 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 		 509 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 516 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 528 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2569  ABC transporter substrate-binding protein  28.43 
 
 		 558 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>