79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5543 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  100 
 
 		 490 aa  973    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  31.99 
 
 		 507 aa  203  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  34.77 
 
 		 477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  25.85 
 
 		 494 aa  162  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  23.19 
 
 		 500 aa  143  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  23.19 
 
 		 500 aa  143  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  25.05 
 
 		 506 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  28.71 
 
 		 445 aa  124  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  29.53 
 
 		 474 aa  123  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  27.96 
 
 		 466 aa  118  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  27.89 
 
 		 442 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  29.12 
 
 		 444 aa  114  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.57 
 
 		 475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  24.71 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  29.64 
 
 		 473 aa  103  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  27.78 
 
 		 474 aa  103  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.31 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  28.4 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  28.4 
 
 		 469 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  25.81 
 
 		 473 aa  96.3  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0685  hypothetical protein  21.52 
 
 		 472 aa  95.9  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00218471  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.07 
 
 		 481 aa  94.4  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  25.75 
 
 		 467 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  26.16 
 
 		 467 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 		 478 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  27.36 
 
 		 471 aa  90.5  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  24.45 
 
 		 480 aa  90.5  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  26.84 
 
 		 455 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  27.4 
 
 		 471 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  25 
 
 		 479 aa  87.4  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  27.91 
 
 		 456 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  29.3 
 
 		 478 aa  86.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 485 aa  86.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 		 523 aa  86.7  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  28.87 
 
 		 454 aa  85.9  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  26.55 
 
 		 464 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  26.93 
 
 		 499 aa  83.2  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 479 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  26.43 
 
 		 465 aa  79.7  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  27.13 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.04 
 
 		 883 aa  76.6  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  23.26 
 
 		 468 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  24.84 
 
 		 466 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.13 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1782  hypothetical protein  24.88 
 
 		 536 aa  75.1  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  27.47 
 
 		 462 aa  73.6  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  28.4 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  31.38 
 
 		 470 aa  73.6  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  28.4 
 
 		 466 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1751 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  28.4 
 
 		 466 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  28.4 
 
 		 466 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  28.4 
 
 		 466 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3875  hypothetical protein  25.24 
 
 		 534 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.408121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 		 455 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  28.4 
 
 		 466 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  28.41 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  28.41 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3137  hypothetical protein  25 
 
 		 534 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  28.75 
 
 		 470 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1963  hypothetical protein  23.44 
 
 		 534 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000030745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1749  hypothetical protein  23.44 
 
 		 534 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000314791  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  23.9 
 
 		 468 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  32.68 
 
 		 468 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01627  hypothetical protein  23.21 
 
 		 534 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373231  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1974  conserved hypothetical protein  23.21 
 
 		 534 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000437192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01637  conserved protein with FAD/NAD(P)-binding domain  23.21 
 
 		 534 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.395296  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  25.83 
 
 		 482 aa  63.5  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2381  hypothetical protein  22.73 
 
 		 534 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000071971  hitchhiker  0.00180659 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4291  hypothetical protein  26.17 
 
 		 483 aa  60.1  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.814822  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  30.2 
 
 		 460 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3130  hypothetical protein  26.54 
 
 		 572 aa  59.3  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1824  hypothetical protein  25.91 
 
 		 582 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000311233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0206  hypothetical protein  22.38 
 
 		 580 aa  51.6  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1205  hypothetical protein  28.28 
 
 		 593 aa  51.2  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2356  hypothetical protein  25.3 
 
 		 578 aa  45.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2537  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.12 
 
 		 1072 aa  44.3  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0617  hypothetical protein  36 
 
 		 624 aa  44.3  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108776  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>