More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5472 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5472  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 198 aa  397  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3726  transcriptional regulator, XRE family  56.83 
 
 		 195 aa  206  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 189 aa  206  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3563  transcriptional regulator, XRE family  51.37 
 
 		 189 aa  184  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1354  XRE family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 190 aa  168  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758784  decreased coverage  0.00460659 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5267  transcriptional regulator, XRE family  48.89 
 
 		 190 aa  167  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.782951 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  40.76 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  41.21 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  44.51 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4522  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 188 aa  134  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0681879  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5130  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  44.05 
 
 		 188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.87177  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1025  XRE family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.976587  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1029  XRE family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 219 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2158  XRE family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00315318  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4259  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.655976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1428  DNA-binding protein  38.89 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  41.21 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0668  XRE family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1147  XRE family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 206 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4768  XRE family transcriptional regulator  43.11 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.2486  normal  0.289686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  42.13 
 
 		 195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1123  XRE family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0106313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5030  transcriptional regulator, XRE family  43.43 
 
 		 189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.938239  normal  0.565327 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0503  transcriptional regulator, XRE family  39.11 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0099  transcriptional regulator, XRE family  37.63 
 
 		 194 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.798061 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  37.91 
 
 		 209 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2728  DNA-binding protein  39.43 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1881  DNA-binding protein  39.43 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0895  DNA-binding protein  39.43 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955987  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2019  DNA-binding protein  39.43 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.649802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3191  DNA-binding protein  39.43 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.479355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3137  DNA-binding protein  37.78 
 
 		 195 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4478  transcriptional regulator  38.51 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3174  DNA-binding protein  38.29 
 
 		 195 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9176  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3403  putative transcriptional regulator  39.89 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2103  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2210  transcriptional regulator, XRE family  36.55 
 
 		 195 aa  98.6  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  34.05 
 
 		 188 aa  97.8  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40150  putative transcriptional regulator  36.07 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5929  XRE family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 202 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.0967353 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1655  helix-turn-helix domain protein  34.07 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000652652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1088  transcriptional regulator  31.07 
 
 		 183 aa  92.8  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0981  DNA-binding protein  30.51 
 
 		 183 aa  91.7  7e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4268  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 178 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  33.96 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  33.96 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  29.56 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1642  XRE family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.065261  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  30.43 
 
 		 178 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  30.53 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4829  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0191257  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.89 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  29.89 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  29.89 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  29.89 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  29.89 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  29.89 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  28.19 
 
 		 185 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  28.43 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  28.43 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  28.43 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  28.43 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  28.43 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  28.43 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  28.43 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  30.98 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  28.98 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2239  transcriptional regulator  27.72 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0224117  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0134  hypothetical protein  28.57 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2197  transcriptional regulator  27.72 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26325  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2463  DNA-binding protein  27.72 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2279  DNA-binding protein  27.72 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268468  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2448  DNA-binding protein  27.72 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.191992  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1957  XRE family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 208 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.210401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0831  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 183 aa  67.8  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000078794  normal  0.173113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>