163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5420 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5420  protein of unknown function DUF427  100 
 
 
94 aa  196  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0261431  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6918  protein of unknown function DUF427  74.19 
 
 
94 aa  150  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.626573  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1745  hypothetical protein  68.54 
 
 
94 aa  132  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0354248 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3182  protein of unknown function DUF427  63.44 
 
 
93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508969 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0315  protein of unknown function DUF427  67.42 
 
 
93 aa  126  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.738281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0506  protein of unknown function DUF427  66.3 
 
 
94 aa  124  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107078  hitchhiker  0.00131958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3986  protein of unknown function DUF427  59.78 
 
 
94 aa  123  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000766725 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1271  hypothetical protein  62.92 
 
 
93 aa  123  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3657  protein of unknown function DUF427  63.74 
 
 
94 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.749637  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16580  hypothetical protein  63.04 
 
 
95 aa  122  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.286452 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1381  hypothetical protein  63.33 
 
 
92 aa  121  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1659  hypothetical protein  60 
 
 
93 aa  121  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1854  hypothetical protein  64.13 
 
 
94 aa  120  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189949  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5114  protein of unknown function DUF427  60.67 
 
 
98 aa  120  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.92446  normal  0.289964 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2564  hypothetical protein  64.13 
 
 
94 aa  120  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.440032  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0029  hypothetical protein  62.22 
 
 
93 aa  119  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.54022 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13333  hypothetical protein  61.11 
 
 
93 aa  119  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.430926  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3292  protein of unknown function DUF427  58.89 
 
 
93 aa  119  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.237584  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2662  hypothetical protein  57.61 
 
 
95 aa  118  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194389  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1404  protein of unknown function DUF427  56.52 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.944619 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3460  hypothetical protein  61.8 
 
 
93 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.967633  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0006  protein of unknown function DUF427  56.52 
 
 
94 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0004  protein of unknown function DUF427  56.52 
 
 
94 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0782  hypothetical protein  56.18 
 
 
92 aa  114  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.060697 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0252  hypothetical protein  56.18 
 
 
93 aa  114  6.9999999999999995e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2270  hypothetical protein  56.52 
 
 
94 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2235  hypothetical protein  59.55 
 
 
93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0124766  hitchhiker  0.000411193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4960  protein of unknown function DUF427  58.89 
 
 
93 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0367366  normal  0.148973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1644  hypothetical protein  58.43 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.891055  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0837  hypothetical protein  56.18 
 
 
93 aa  107  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.394085  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2074  hypothetical protein  54.44 
 
 
102 aa  107  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.915864  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0111  hypothetical protein  53.26 
 
 
93 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.733317 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11687  hypothetical protein  53.61 
 
 
115 aa  102  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209291  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2442  hypothetical protein  51.69 
 
 
94 aa  100  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.88433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0965  hypothetical protein  46.74 
 
 
94 aa  95.5  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0139662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3377  hypothetical protein  54.05 
 
 
75 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.224169  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0438  hypothetical protein  46.51 
 
 
94 aa  86.7  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1748  hypothetical protein  46.67 
 
 
94 aa  85.1  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.803353  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1675  protein of unknown function DUF427  46.39 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5702  hypothetical protein  42.05 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11076  DUF427 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02220)  41.57 
 
 
100 aa  72.4  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0690  protein of unknown function DUF427  44.19 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.822269  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2271  hypothetical protein  50.72 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000495409  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2618  hypothetical protein  41.57 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.228349  normal  0.0222891 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0283  hypothetical protein  36.05 
 
 
274 aa  63.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3776  hypothetical protein  37.93 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0718949  normal  0.0555317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1190  hypothetical protein  35.63 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880382  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4910  protein of unknown function DUF427  39.29 
 
 
164 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186738  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5462  hypothetical protein  36.67 
 
 
123 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1654  hypothetical protein  37.93 
 
 
165 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.026599  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4538  protein of unknown function DUF427  36.05 
 
 
249 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1110  hypothetical protein  46.88 
 
 
129 aa  62  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2722  hypothetical protein  37.78 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.696905  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0310  hypothetical protein  37.5 
 
 
118 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0354  protein of unknown function DUF427  37.5 
 
 
118 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5019  protein of unknown function DUF427  37.93 
 
 
166 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5084  hypothetical protein  35.56 
 
 
123 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.366298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5172  hypothetical protein  35.56 
 
 
123 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2093  protein of unknown function DUF427  37.21 
 
 
164 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2069  protein of unknown function DUF427  37.21 
 
 
164 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1748  protein of unknown function DUF427  35.71 
 
 
163 aa  60.1  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0012461  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2621  hypothetical protein  40 
 
 
125 aa  60.5  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2534  protein of unknown function DUF427  36.78 
 
 
175 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1793  protein of unknown function DUF427  34.83 
 
 
265 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2744  hypothetical protein  34.09 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0532272  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3697  hypothetical protein  35.48 
 
 
265 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391658  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3161  hypothetical protein  37.5 
 
 
164 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.636241  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3005  hypothetical protein  37.5 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1298  hypothetical protein  37.93 
 
 
165 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3361  hypothetical protein  33.71 
 
 
122 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0094  hypothetical protein  35.56 
 
 
166 aa  58.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.569899  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4864  protein of unknown function DUF427  36.9 
 
 
164 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0246327 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1788  protein of unknown function DUF427  32.95 
 
 
120 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06900  conserved hypothetical protein  40.7 
 
 
109 aa  57  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470322  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0373  hypothetical protein  34.48 
 
 
185 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1318  hypothetical protein  35.63 
 
 
162 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5492  hypothetical protein  35.23 
 
 
169 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0175  protein of unknown function DUF427  39.71 
 
 
297 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4401  hypothetical protein  36.9 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528478  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2990  hypothetical protein  36.36 
 
 
166 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3034  hypothetical protein  36.36 
 
 
166 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2185  protein of unknown function DUF427  38.46 
 
 
264 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.485645  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4092  hypothetical protein  45.16 
 
 
254 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681938  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1711  protein of unknown function DUF427  43.75 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212049  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0902  protein of unknown function DUF427  35.23 
 
 
166 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.336463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0086  protein of unknown function DUF427  34.07 
 
 
118 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0092  protein of unknown function DUF427  34.07 
 
 
118 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0640  hypothetical protein  31.58 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10141  hypothetical protein  34.83 
 
 
126 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3711  hypothetical protein  39.06 
 
 
120 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224124  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4022  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1593  hypothetical protein  31.76 
 
 
121 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.337272 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2022  hypothetical protein  32.61 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2211  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0198  hypothetical protein  36.96 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.057512  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2689  protein of unknown function DUF427  31.76 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163482  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2009  hypothetical protein  45.16 
 
 
248 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.147252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3721  hypothetical protein  38.81 
 
 
126 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0946266  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3263  protein of unknown function DUF427  44.62 
 
 
130 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187947  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3071  hypothetical protein  34.74 
 
 
113 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711545  normal  0.613133 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>