62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5349 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5349  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  100 
 
 		 103 aa  209  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0125  transcriptional regulator, MarR family  73.74 
 
 		 104 aa  155  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1413  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  53.85 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22783  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0548  transcriptional regulator  55.06 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0542842  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0081  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  52.87 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0592  transcriptional regulator, ArsR family  47.78 
 
 		 105 aa  91.7  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.751987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0308  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  45.74 
 
 		 97 aa  88.6  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.762623 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4223  transcriptional regulator, MarR family  51.14 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.135202  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6424  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  61.36 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1114  regulatory protein MarR  46.15 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0481626  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2542  transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  49.43 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0791599  normal  0.380837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4102  transcriptional regulator  41.76 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404387  normal  0.0188241 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2593  hypothetical protein  42.86 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5191  putative transcriptional regulator  44.05 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0331978  normal  0.592256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4065  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.686189  normal  0.326424 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3477  MarR/EmrR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30320  hypothetical protein  40.26 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4271  hypothetical protein  42.67 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350717  normal  0.351031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4140  hypothetical protein  36.26 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.609006 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0611  transcriptional regulator, MarR/EmrR family  33.7 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4596  hypothetical protein  41.38 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505761  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2811  transcriptional regulator  35.79 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0710  transcriptional regulator, ArsR family  43.53 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4026  hypothetical protein  39.78 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.252958 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3273  transcriptional regulator  43.18 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1682  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1698  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354656  normal  0.781335 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0422  transcriptional regulator  30.38 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0060  regulatory protein, ArsR  34.04 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7857  hypothetical protein  32.98 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739073  normal  0.172696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1630  putative transcriptional regulator  29.79 
 
 		 120 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.917024  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1486  hypothetical protein  27.18 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0003803  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3450  hypothetical protein  33 
 
 		 101 aa  50.4  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12100  hypothetical protein  41.11 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2579  transcriptional regulator  28.24 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1862  hypothetical protein  36.17 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361874  normal  0.015188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2689  putative transcriptional regulator  29.79 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1184  transcriptional regulator, ArsR family  28.41 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0470  hypothetical protein  30.21 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0242594 
 
 
-
 
NC_002950  PG2225  hypothetical protein  31.65 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000123017 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1598  putative PAS/PAC sensor protein  27.78 
 
 		 326 aa  47  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2000  transcriptional regulator  26.97 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2191  regulatory protein, ArsR  28.72 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0239  hypothetical protein  26.53 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15068  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4544  hypothetical protein  27.52 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.234964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4062  hypothetical protein  26.61 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4430  hypothetical protein  26.61 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1599  ArsR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.556289  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03040  hypothetical protein  41.07 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0139  transcriptional regulator  27.63 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3344  transcriptional regulator, MarR family  42.42 
 
 		 218 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.670275  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1065  regulatory protein ArsR  39.68 
 
 		 124 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 156 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1300  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 106 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.223469  normal  0.471432 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  40 
 
 		 161 aa  42  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3137  hypothetical protein  29.17 
 
 		 127 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.581839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1426  hypothetical protein  36.26 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0952  hypothetical protein  27.84 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.411513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3384  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1247  putative PAS/PAC sensor protein  25 
 
 		 327 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.977121  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1413  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.946834  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  49.09 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>