47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5213 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5213  putative aminoglycoside phosphotransferase protein (antibiotic resistance protein)  100 
 
 		 279 aa  553  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7402  hypothetical protein  42.26 
 
 		 266 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2772  aminoglycoside phosphotransferase  40.74 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1734  aminoglycoside phosphotransferase  41.6 
 
 		 283 aa  148  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1296  aminoglycoside phosphotransferase  39.34 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1186  aminoglycoside phosphotransferase  40.42 
 
 		 286 aa  138  8.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2126  aminoglycoside phosphotransferase  38.77 
 
 		 247 aa  138  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.171035  normal  0.0430024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5537  aminoglycoside phosphotransferase  37.5 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72204  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4777  aminoglycoside phosphotransferase  38.37 
 
 		 281 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.266614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2040  aminoglycoside phosphotransferase  35.42 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3328  aminoglycoside phosphotransferase  32.41 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2798  aminoglycoside phosphotransferase  37.4 
 
 		 264 aa  125  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1230  trifolitoxin immunity domain-containing protein  31.6 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000170799  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1031  trifolitoxin immunity protein  32.03 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1028  trifolitoxin immunity protein  32.03 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4156  trifolitoxin immunity protein  31.34 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000289256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1288  trifolitoxin immunity domain protein  30.15 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000214818  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1183  trifolitoxin immunity protein  31.34 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00210871  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1053  trifolitoxin immunity domain-containing protein  31.76 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000137711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1133  trifolitoxin immunity domain-containing protein  31.76 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000583619  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04894  hypothetical protein  33.08 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1471  putative antibiotic resistance protein  33.33 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.292447  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6530  aminoglycoside phosphotransferase  41.71 
 
 		 238 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0352215  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3172  aminoglycoside phosphotransferase  38.81 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0232436  hitchhiker  0.0000000099783 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4227  aminoglycoside phosphotransferase  35.83 
 
 		 324 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.722733 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5377  aminoglycoside phosphotransferase  35.9 
 
 		 265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.556886  normal  0.652804 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0079  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3956  aminoglycoside phosphotransferase  38.07 
 
 		 251 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1984  putative TfxG-like immunity protein against TfxA-like peptides  35.34 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000753  hypothetical protein  30 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2262  aminoglycoside phosphotransferase  39.11 
 
 		 253 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.657806 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2326  aminoglycoside phosphotransferase  37.5 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030159 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0761  aminoglycoside phosphotransferase  30.11 
 
 		 273 aa  99  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1421  putative trifolitoxin immunity protein  32.95 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1395  putative trifolitoxin immunity protein  33.98 
 
 		 243 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.815075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1068  aminoglycoside phosphotransferase  39.41 
 
 		 252 aa  95.5  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14970  putative homoserine kinase type II (protein kinase fold)  33.63 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.448489  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35590  phosphotransferase family protein  32.81 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.886492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2954  aminoglycoside phosphotransferase  35.94 
 
 		 255 aa  86.3  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00316699  decreased coverage  0.00012693 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1212  trifolitoxin immunity protein  37.86 
 
 		 140 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2966  aminoglycoside phosphotransferase  31.72 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3867  aminoglycoside phosphotransferase  35.15 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499671  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0822  hypothetical protein  40.31 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0740155  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1013  aminoglycoside phosphotransferase  34.25 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1892  aminoglycoside phosphotransferase  41.18 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3823  aminoglycoside phosphotransferase  35.63 
 
 		 344 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0685  homoserine kinase  29.71 
 
 		 321 aa  42  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321232  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>