More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5212 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  100 
 
 		 200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  51.26 
 
 		 200 aa  190  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  40.93 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  39.81 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12360  methyltransferase family protein  39.3 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661079  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.77 
 
 		 268 aa  111  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4583  Methyltransferase type 11  38.38 
 
 		 220 aa  108  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.130075 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5548  Methyltransferase type 11  38.35 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.18 
 
 		 233 aa  99.8  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4082  methyltransferase type 12  34.36 
 
 		 198 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0341683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1258  hypothetical protein  46.1 
 
 		 238 aa  95.1  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1502  Methyltransferase type 12  36 
 
 		 223 aa  94  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  38.76 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1197  Methyltransferase type 12  28.46 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  42.45 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  36.91 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  36.52 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  42.27 
 
 		 241 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.09 
 
 		 285 aa  64.7  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  37.98 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  29.57 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  29.29 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  37.01 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  38 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  28.48 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  28.48 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  28.48 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  32.59 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.58 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 401 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  28.7 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  41.41 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  39.45 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  27.85 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  27.85 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  40.19 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  29.17 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  39.2 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  27.85 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  34.23 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  27.85 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  39.36 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  27.85 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  38 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  32.06 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  27.89 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0122  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 363 aa  58.5  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.678771  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4911  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.32 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.168902 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.59 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  21.93 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  21.93 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  21.93 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  21.93 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  21.93 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  21.93 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  21.93 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  32.35 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.86 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  32.35 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  29.58 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.46 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2762  methyltransferase  31.07 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  31.97 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  33.94 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  31.37 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  35.29 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 270 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  33.58 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.46 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.1 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.89 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1309  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.0297047 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0761  Methyltransferase type 11  25.48 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.818805 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  39.8 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.75 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.1 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  25.74 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4181  methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  33.55 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  38.6 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  37.38 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>