35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5090 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5090  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  561  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5272  hypothetical protein  68.06 
 
 		 271 aa  348  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4101  hypothetical protein  65.12 
 
 		 271 aa  341  8e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.773916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0994  hypothetical protein  67.08 
 
 		 272 aa  326  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2963  hypothetical protein  61.24 
 
 		 283 aa  318  9e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0051  aminotransferase class IV  34.36 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0049  hypothetical protein  39.21 
 
 		 265 aa  149  5e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.732388  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02146  hypothetical protein  37.72 
 
 		 265 aa  142  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3563  aminotransferase class IV  36.29 
 
 		 262 aa  135  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0184  hypothetical protein  31.4 
 
 		 259 aa  128  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2260  aminotransferase class IV  37.45 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00278928  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4210  hypothetical protein  32.7 
 
 		 313 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  0.890959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3082  hypothetical protein  34.63 
 
 		 259 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15150  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  36 
 
 		 273 aa  123  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784526  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1152  hypothetical protein  38.6 
 
 		 270 aa  122  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3435  hypothetical protein  32.43 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  28.83 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2650  aminotransferase, class IV  23.5 
 
 		 271 aa  52.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  24.8 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  25.5 
 
 		 284 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  26.67 
 
 		 282 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  28.34 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  30.94 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  26.04 
 
 		 741 aa  46.2  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2383  aminotransferase class IV  26.96 
 
 		 313 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50806  predicted protein  24.88 
 
 		 588 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2654  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  31.08 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2119  aminotransferase, class IV  24.64 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00194364  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3389  aminotransferase, class IV  32.82 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2744  aminotransferase class IV  29.53 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1734  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  30.26 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0256698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1764  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  30.26 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2243  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.9 
 
 		 268 aa  42.7  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000604374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1659  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  30.26 
 
 		 269 aa  42.7  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0501758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  31.82 
 
 		 285 aa  42.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>