236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4929 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  66.18 
 
 		 212 aa  271  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 205 aa  95.1  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0905  putative transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  35.39 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 219 aa  81.3  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  24.86 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0148  putative transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  29.79 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0698  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0672339  normal  0.970629 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  24.12 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  26.02 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  21.55 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  23.57 
 
 		 181 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  22.51 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  21.2 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03830  transcriptional regulator, tetR family  32.35 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  19.89 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  25.75 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  20.99 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  25.44 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  20.65 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  20.99 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0215  transcriptional regulator  25.89 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.532306  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  20.22 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  22.41 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  31.31 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0431  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  22.45 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  23.26 
 
 		 181 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1094  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0421  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 182 aa  52.4  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  21.39 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  21.72 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 178 aa  52.4  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2767  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2811  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548519  normal  0.159647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2794  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.630327  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  45.9 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3306  regulatory protein TetR  37.29 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000516611  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  22.29 
 
 		 181 aa  52  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24500  transcriptional regulator  26.79 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0079  transcriptional regulator, TetR family  22.62 
 
 		 188 aa  51.6  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0990564  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1104  AcrR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 243 aa  51.6  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3735  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0758  transcriptional regulator  21.34 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000100978  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  22.63 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>