More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4866 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4866  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0882  transcriptional regulator, GntR family  80.6 
 
 		 134 aa  222  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.905481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  62.31 
 
 		 130 aa  158  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6591  GntR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30942  normal  0.691161 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  60.94 
 
 		 131 aa  147  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2227  transcriptional regulator, GntR family  55.37 
 
 		 129 aa  130  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  55 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  53.28 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  55.17 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3575  transcriptional regulator, GntR family  49.59 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00235324  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  36.13 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 129 aa  76.6  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3243  regulatory protein GntR, HTH  35.09 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  30.91 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0430  transcriptional regulator, GntR family  40.54 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  35.45 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1803  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0960  transcriptional regulator, GntR family  42.11 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  44.59 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1357  regulatory protein GntR, HTH  28.8 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  39.24 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0541  regulatory protein GntR HTH  40.26 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000336324  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  28.35 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  39.24 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  39.24 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  39.24 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  38.66 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0374  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  35.44 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  32.95 
 
 		 126 aa  62  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  40.79 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  39.02 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0570  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506154 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  41.33 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  41.67 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  39.47 
 
 		 554 aa  62  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  41.1 
 
 		 482 aa  61.6  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.74 
 
 		 471 aa  60.5  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.52 
 
 		 483 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  27.19 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0347  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 519 aa  60.1  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0356  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 520 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.716166  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  36.59 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.99 
 
 		 468 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 498 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.44 
 
 		 479 aa  58.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 473 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3120  regulatory protein GntR HTH  32.98 
 
 		 337 aa  58.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.109016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  28.57 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1647  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 467 aa  57.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.420905 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2460  GntR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 478 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1122  transcriptional regulator, GntR family  34.25 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379756 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  42.03 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  32.11 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  27.43 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1930  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.26 
 
 		 498 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.199389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 473 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0018  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 467 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2982  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.583811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0076  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 488 aa  57  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  34.91 
 
 		 480 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1988  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>