More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4846 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  100 
 
 		 222 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  50.57 
 
 		 235 aa  169  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  44.65 
 
 		 231 aa  162  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  47.24 
 
 		 224 aa  161  6e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  45.97 
 
 		 230 aa  161  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  48.57 
 
 		 229 aa  158  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  43.78 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  45.97 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  38.64 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  45.28 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 241 aa  148  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  37.27 
 
 		 226 aa  147  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  34.68 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  51.2 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  44.08 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  43.72 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  43 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  42.23 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  44.44 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  46.97 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 235 aa  138  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  33.78 
 
 		 230 aa  138  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  40.99 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  41.78 
 
 		 224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  40.67 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  44.81 
 
 		 224 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  38.76 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 225 aa  128  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  46.39 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  40.19 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  41.09 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  41.75 
 
 		 231 aa  125  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  35.85 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  42.6 
 
 		 234 aa  121  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  37.61 
 
 		 225 aa  121  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  34.12 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  36.74 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  43.81 
 
 		 227 aa  118  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 216 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  37.93 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  40.84 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  37.44 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  46.86 
 
 		 226 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  35.81 
 
 		 216 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  34.56 
 
 		 231 aa  115  7.999999999999999e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  37.44 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 255 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19650  transcriptional regulator, GntR family  41.12 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.230789  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  37.56 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  35.41 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  27.52 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  31.82 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  29.91 
 
 		 229 aa  101  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  34.93 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  34.6 
 
 		 241 aa  99  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0567  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 234 aa  98.6  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.837361  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  36.82 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  36.82 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  36.82 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  36.82 
 
 		 258 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3389  GntR domain protein  31.58 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422325  hitchhiker  0.000247854 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  36.82 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  36.82 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  36.82 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  33.5 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  36.82 
 
 		 258 aa  97.1  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  34.6 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  36.82 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  42.48 
 
 		 249 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0553  GntR domain protein  38.94 
 
 		 253 aa  96.3  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2597  GntR domain-containing protein  31.44 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130942 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  35.78 
 
 		 257 aa  95.5  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3324  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2462  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3461  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.488404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3424  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1242  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0381  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  36.89 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1141  GntR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3459  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34.93 
 
 		 256 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 258 aa  93.6  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34.93 
 
 		 256 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  36.41 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  34.11 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  34.33 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  36.98 
 
 		 239 aa  92.4  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  34.53 
 
 		 250 aa  92.4  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>