More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4838 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  59.61 
 
 
572 aa  637    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  66.73 
 
 
567 aa  713    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  81.59 
 
 
591 aa  890    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 
566 aa  1110    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  55.99 
 
 
571 aa  591  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  49.56 
 
 
568 aa  479  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  47.67 
 
 
573 aa  438  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.32 
 
 
573 aa  427  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.91 
 
 
566 aa  420  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  48.66 
 
 
588 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  46.83 
 
 
577 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 
592 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.15 
 
 
578 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.58 
 
 
544 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 
580 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 
595 aa  388  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.14 
 
 
559 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 
566 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 
565 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 
566 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 
566 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  42.98 
 
 
578 aa  360  3e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.31 
 
 
575 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 
579 aa  352  7e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  43.61 
 
 
536 aa  352  8.999999999999999e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 
568 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 
568 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 
568 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.19 
 
 
631 aa  344  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 
556 aa  342  9e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  41.98 
 
 
573 aa  322  8e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 
543 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6099  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 
525 aa  307  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
568 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 
535 aa  302  9e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  38.65 
 
 
543 aa  300  4e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  36.92 
 
 
549 aa  296  7e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 
535 aa  285  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 
590 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0109809  hitchhiker  0.000893685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3326  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 
571 aa  273  6e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.742829 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1613  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.38 
 
 
550 aa  206  8e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23240  histidine kinase with GAF domain protein  31.43 
 
 
635 aa  203  8e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  38.98 
 
 
385 aa  186  8e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0157  putative phytochrome sensor protein  39 
 
 
401 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  55.36 
 
 
392 aa  179  9e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
409 aa  172  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0274237 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11340  histidine kinase with GAF domain  35.55 
 
 
391 aa  171  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00610406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 
372 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.642474  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.08 
 
 
381 aa  147  7.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.77 
 
 
456 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0508  putative PAS/PAC sensor protein  37.25 
 
 
673 aa  126  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663118  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  34.1 
 
 
851 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.94 
 
 
386 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 
665 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
421 aa  117  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 
725 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1421  ATPase domain-containing protein  38.94 
 
 
484 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.595659  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  32.52 
 
 
828 aa  112  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  30.31 
 
 
373 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4209  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
795 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4655  putative PAS/PAC sensor protein  31.74 
 
 
535 aa  104  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 
393 aa  103  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 
464 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33000  PAS domain S-box  31.12 
 
 
547 aa  101  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.569309  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18330  histidine kinase  36.62 
 
 
382 aa  98.6  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01200  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarL  32.58 
 
 
598 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2424  histidine kinase  32.58 
 
 
598 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0527369  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2401  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.58 
 
 
598 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1705  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.58 
 
 
598 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.55706  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1372  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.58 
 
 
598 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.497152  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01210  hypothetical protein  32.58 
 
 
598 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.678292  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1331  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.58 
 
 
598 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.150699  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1918  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.21 
 
 
598 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184147  normal  0.168413 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 
352 aa  97.4  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 
517 aa  97.1  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1389  nitrate/nitrite sensor protein NarX  32.21 
 
 
598 aa  95.9  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0922186  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
682 aa  94.7  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38430  PAS domain S-box  28.71 
 
 
552 aa  94.4  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2170  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 
550 aa  94  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 
545 aa  93.2  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
345 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
574 aa  92  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2522  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.17 
 
 
380 aa  92  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
552 aa  91.7  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
621 aa  92  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2317  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.07 
 
 
598 aa  91.7  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 
373 aa  91.3  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2123  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.75 
 
 
593 aa  90.9  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2261  nitrate/nitrite sensor protein NarX  31.09 
 
 
602 aa  90.9  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0999245  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2232  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.75 
 
 
593 aa  90.9  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1767  nitrate/nitrite sensor protein NarX  31.73 
 
 
604 aa  90.5  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
570 aa  90.5  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
1014 aa  90.1  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  24.71 
 
 
377 aa  89  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2047  sensor histidine kinase  25.47 
 
 
372 aa  89.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.362734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2289  sensor histidine kinase  25.47 
 
 
372 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25894e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2108  sensor histidine kinase  25.47 
 
 
372 aa  88.6  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2264  sensor histidine kinase  25.47 
 
 
365 aa  88.6  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.361221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13740  two-component sensor NarX  27.49 
 
 
622 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.869934  normal  0.455278 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2045  sensor histidine kinase  25.47 
 
 
372 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>