More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4831 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  567  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  52.63 
 
 
289 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  50.69 
 
 
288 aa  268  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  51.74 
 
 
288 aa  268  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  49.46 
 
 
290 aa  235  6e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  47.55 
 
 
299 aa  218  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  47.06 
 
 
291 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  47.89 
 
 
283 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  44.88 
 
 
282 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  46.81 
 
 
284 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  43.11 
 
 
301 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  42.66 
 
 
287 aa  188  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  46.55 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  45.7 
 
 
287 aa  178  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  43.06 
 
 
289 aa  176  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  42.07 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  39.53 
 
 
293 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  40.75 
 
 
277 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  37.28 
 
 
289 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  40.48 
 
 
298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  42.29 
 
 
285 aa  155  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  38.83 
 
 
289 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 
293 aa  153  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  39.74 
 
 
293 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  44.49 
 
 
229 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  38.81 
 
 
297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  38.75 
 
 
296 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  42.36 
 
 
293 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  41.96 
 
 
277 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  38.97 
 
 
293 aa  149  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2336  UspA domain-containing protein  45.77 
 
 
289 aa  149  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71731  normal  0.885164 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  37.75 
 
 
295 aa  149  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  39.19 
 
 
291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  43.06 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  39.59 
 
 
297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  38.83 
 
 
293 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  38.83 
 
 
293 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  38.49 
 
 
293 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  37.19 
 
 
296 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  41.69 
 
 
303 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  40.75 
 
 
277 aa  143  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  38.68 
 
 
289 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  37.8 
 
 
298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  37.8 
 
 
298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  37.8 
 
 
298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  35.99 
 
 
297 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 
294 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  35.59 
 
 
295 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  35.59 
 
 
295 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  35.59 
 
 
295 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  35.81 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
341 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3530  UspA domain protein  36.71 
 
 
281 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.636881  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 
295 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  36.27 
 
 
290 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  33.45 
 
 
341 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  33.45 
 
 
341 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  41.28 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  37.19 
 
 
293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  42.47 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  37.15 
 
 
294 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  38.21 
 
 
305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  34.63 
 
 
315 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  36.08 
 
 
292 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  32.4 
 
 
296 aa  128  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  36.08 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  36.08 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  41.46 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  41.36 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  37.28 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  37.54 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  35.74 
 
 
294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  42.71 
 
 
295 aa  126  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  37.2 
 
 
294 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  37.2 
 
 
294 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  36.08 
 
 
322 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  39.79 
 
 
276 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  40.45 
 
 
393 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  37.58 
 
 
321 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  40.8 
 
 
302 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  38.28 
 
 
307 aa  123  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 
295 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  36.33 
 
 
300 aa  122  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  34.25 
 
 
347 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  36.82 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  34.83 
 
 
290 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  38.25 
 
 
302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  37.28 
 
 
309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  33.44 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  36.14 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  35.81 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  35.71 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  35.78 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  35.57 
 
 
298 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0338  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 
298 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.23658 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  36.88 
 
 
310 aa  115  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3441  UspA domain-containing protein  38.38 
 
 
271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118762  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  37.8 
 
 
339 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>