More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4822 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  100 
 
 
289 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  55.75 
 
 
288 aa  311  7.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  53.31 
 
 
288 aa  305  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  55.43 
 
 
290 aa  297  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  52.63 
 
 
292 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  50.35 
 
 
299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  50.53 
 
 
282 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  49.65 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  46.85 
 
 
287 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  44.33 
 
 
301 aa  199  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  45.49 
 
 
291 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  42.36 
 
 
287 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  42.55 
 
 
284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  42.42 
 
 
289 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  41.2 
 
 
288 aa  159  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  42.91 
 
 
288 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2336  UspA domain-containing protein  45.17 
 
 
289 aa  151  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71731  normal  0.885164 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  39.93 
 
 
307 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 
293 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  36.46 
 
 
297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  40.21 
 
 
285 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  40.21 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  39.13 
 
 
293 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  37.54 
 
 
277 aa  139  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  35.29 
 
 
347 aa  138  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  38.54 
 
 
293 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  41.84 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 
294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 
293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 
296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  35.05 
 
 
293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  37.37 
 
 
298 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
292 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  41.3 
 
 
229 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  41.26 
 
 
276 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  36.36 
 
 
292 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 
292 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  39.04 
 
 
296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  37.76 
 
 
373 aa  128  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  35.4 
 
 
293 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  34.49 
 
 
295 aa  127  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  34.59 
 
 
294 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 
296 aa  125  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  34.81 
 
 
289 aa  125  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  35.93 
 
 
291 aa  125  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 
297 aa  125  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1479  UspA domain protein  39.79 
 
 
286 aa  125  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  39.25 
 
 
314 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  34.77 
 
 
317 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  33.9 
 
 
289 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  37.94 
 
 
305 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  39.58 
 
 
393 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  38.78 
 
 
339 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  36.75 
 
 
277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  35.05 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  36.54 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  35.05 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  34.35 
 
 
345 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 
295 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  34.71 
 
 
293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  35.6 
 
 
308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  35.71 
 
 
341 aa  119  6e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  33.79 
 
 
294 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
294 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  34.95 
 
 
289 aa  119  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  39.16 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  37.25 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  32.88 
 
 
341 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 
341 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  34.59 
 
 
295 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  34.59 
 
 
295 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  34.59 
 
 
295 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  34.42 
 
 
300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  36.36 
 
 
277 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  30.6 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  31.89 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  36.39 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  39.73 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  32.87 
 
 
294 aa  113  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  31.72 
 
 
290 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  36.88 
 
 
296 aa  112  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3041  putative stress-inducible protein  36.14 
 
 
325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.921902  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  36.39 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 
296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  34.01 
 
 
322 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
290 aa  109  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  36.68 
 
 
294 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  36.68 
 
 
294 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  36.68 
 
 
294 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  31.51 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  33.77 
 
 
306 aa  108  9.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  32.26 
 
 
305 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 
298 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  34.85 
 
 
310 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  34.15 
 
 
298 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 
298 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  38.89 
 
 
295 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>