231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4819 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  53.65 
 
 
706 aa  644    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  60.33 
 
 
631 aa  708    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  100 
 
 
625 aa  1278    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  56.48 
 
 
677 aa  673    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  58.56 
 
 
676 aa  674    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  65.04 
 
 
647 aa  762    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  50 
 
 
687 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2657  spore coat protein A  45.74 
 
 
840 aa  570  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  43.38 
 
 
1094 aa  552  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  47.57 
 
 
698 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  37.26 
 
 
625 aa  330  3e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  35.89 
 
 
620 aa  320  7e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  34.42 
 
 
708 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  35.45 
 
 
523 aa  270  8e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  30.79 
 
 
661 aa  264  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2583  twin-arginine translocation pathway signal  31.51 
 
 
734 aa  227  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.574228  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4099  multicopper oxidase type 2  31.05 
 
 
779 aa  219  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  31.59 
 
 
536 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2680  Bilirubin oxidase  31.46 
 
 
647 aa  212  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  30.07 
 
 
779 aa  208  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2248  multicopper oxidase, type 2  34.62 
 
 
872 aa  201  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3376  multicopper oxidase type 2  30.53 
 
 
798 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.407133  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3299  multicopper oxidase, type 2  29.16 
 
 
798 aa  193  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  29.15 
 
 
508 aa  190  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3440  multicopper oxidase type 2  29.7 
 
 
799 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.912192  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  32.42 
 
 
515 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  28.81 
 
 
643 aa  185  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  29.03 
 
 
512 aa  184  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  30.94 
 
 
496 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  28.07 
 
 
679 aa  173  7.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  31.93 
 
 
528 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  33.01 
 
 
487 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3381  multicopper oxidase type 2  30.28 
 
 
628 aa  157  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  29.41 
 
 
536 aa  150  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  34.22 
 
 
486 aa  147  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  31.68 
 
 
490 aa  146  9e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  29.98 
 
 
510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  28 
 
 
547 aa  140  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  27.6 
 
 
569 aa  139  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  27.85 
 
 
551 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  29.89 
 
 
527 aa  131  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  28.5 
 
 
504 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  30.55 
 
 
505 aa  128  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  28.71 
 
 
519 aa  127  5e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  28.02 
 
 
502 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  28.02 
 
 
502 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  26.55 
 
 
464 aa  124  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  28.78 
 
 
532 aa  124  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  28.71 
 
 
499 aa  124  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  26.61 
 
 
534 aa  124  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  26.61 
 
 
534 aa  123  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  27.7 
 
 
506 aa  123  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  27.45 
 
 
488 aa  122  3e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4297  Bilirubin oxidase  26.86 
 
 
877 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  29.38 
 
 
519 aa  117  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  27.73 
 
 
1380 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  27.45 
 
 
1363 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  27.83 
 
 
516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  28.4 
 
 
528 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  25.28 
 
 
533 aa  112  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0069  Bilirubin oxidase  27.97 
 
 
603 aa  110  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  27.68 
 
 
516 aa  109  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  27.12 
 
 
1363 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  27.68 
 
 
529 aa  109  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  27.61 
 
 
519 aa  109  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  27.23 
 
 
529 aa  108  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  27.46 
 
 
516 aa  108  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  27.23 
 
 
529 aa  108  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  27.46 
 
 
516 aa  107  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  27.46 
 
 
516 aa  107  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  27.46 
 
 
516 aa  107  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  27.46 
 
 
516 aa  107  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2591  multicopper oxidase type 2  23.62 
 
 
895 aa  106  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0400357 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2532  multicopper oxidase, type 2  23.65 
 
 
1131 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2665  multicopper oxidase type 2  23.3 
 
 
1131 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.717674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6341  Bilirubin oxidase  24.51 
 
 
760 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  27.48 
 
 
536 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  27.48 
 
 
536 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.25 
 
 
579 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3108  multicopper oxidase type 2  25.54 
 
 
1430 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507653  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.23 
 
 
586 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.23 
 
 
536 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.23 
 
 
536 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.23 
 
 
536 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  33.83 
 
 
1272 aa  101  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0492  multicopper oxidase type 2  33.17 
 
 
645 aa  100  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3184  hypothetical protein  22.54 
 
 
1131 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  25.87 
 
 
535 aa  98.6  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  25.25 
 
 
535 aa  98.2  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.54 
 
 
591 aa  97.8  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  26.7 
 
 
536 aa  97.4  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  26.75 
 
 
536 aa  97.4  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  26.7 
 
 
536 aa  97.4  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1178  multicopper oxidase type 3  27.06 
 
 
575 aa  96.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  26.75 
 
 
536 aa  96.3  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  25.18 
 
 
515 aa  95.5  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  26.75 
 
 
536 aa  96.3  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  25.06 
 
 
535 aa  94.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  25.06 
 
 
535 aa  94.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  27.22 
 
 
1201 aa  94.4  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>