117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4808 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4808  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  443  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.463187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4549  hypothetical protein  74.66 
 
 		 236 aa  314  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4684  hypothetical protein  69.82 
 
 		 224 aa  311  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213112  normal  0.375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6155  hypothetical protein  67.57 
 
 		 225 aa  309  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  hitchhiker  0.000659717 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.79 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2051  hypothetical protein  52.27 
 
 		 146 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0320963  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0947  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  40.77 
 
 		 154 aa  89.4  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.011553  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4254  hypothetical protein  38.35 
 
 		 136 aa  88.6  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3622  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  36.96 
 
 		 147 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3695  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  36.96 
 
 		 147 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.164379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3627  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  36.96 
 
 		 147 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0499  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  40.91 
 
 		 142 aa  87  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2951  hypothetical protein  36.36 
 
 		 145 aa  84  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3506  hypothetical protein  36.36 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2259  hypothetical protein  37.88 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3638  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  34.78 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1545  hypothetical protein  39.39 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0980761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2134  hypothetical protein  35.1 
 
 		 185 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00539509  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2138  hypothetical protein  32.82 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3292  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  36.88 
 
 		 143 aa  77.4  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000330862  normal  0.034856 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10081  hypothetical protein  34.25 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.239804  normal  0.111783 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3379  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09680  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  37.21 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.313838  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4928  hypothetical protein  37.24 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.52831  normal  0.121155 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5621  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1002  hypothetical protein  32.03 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45242  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1885  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.11 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00315064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1961  hypothetical protein  32.85 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000972412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4105  hypothetical protein  32.09 
 
 		 135 aa  72  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0929325  normal  0.139081 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1083  hypothetical protein  32.56 
 
 		 139 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00152048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1100  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  32.56 
 
 		 139 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.238295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1111  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  32.56 
 
 		 139 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4069  hypothetical protein  32.59 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0384  hypothetical protein  31.58 
 
 		 135 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0163229  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0393  hypothetical protein  31.58 
 
 		 135 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.831448  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0372  hypothetical protein  31.58 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.396466  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1183  hypothetical protein  32.56 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0952  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  31.78 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0993  putative DNA-binding protein  31.88 
 
 		 140 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0633  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.33 
 
 		 140 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429345  normal  0.0292132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3095  hypothetical protein  31.06 
 
 		 164 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.929414 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0873  hypothetical protein  32.06 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2085  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.09 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000125188 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0999  hypothetical protein  37.78 
 
 		 135 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2075  hypothetical protein  31.58 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000436269 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  33.33 
 
 		 142 aa  62  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468979  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0261  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  32.85 
 
 		 140 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00900094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0498  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  31.54 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0982  hypothetical protein  30.88 
 
 		 144 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175108 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2084  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.36 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000123288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4835  hypothetical protein  29.01 
 
 		 155 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6100  hypothetical protein  35.29 
 
 		 134 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04380  predicted flavin-nucleotide-binding protein  26.36 
 
 		 174 aa  49.3  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 83 aa  48.5  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 252 aa  48.5  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  39.19 
 
 		 84 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4469  helix-turn-helix domain-containing protein  27.88 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4983  transcriptional regulator, XRE family  28.16 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0953387  normal  0.300371 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4933  transcriptional regulator, XRE family  27.88 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 76 aa  47.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  39.19 
 
 		 81 aa  46.6  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0353  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  28.06 
 
 		 135 aa  47  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.934539  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 105 aa  47  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1228  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 85 aa  46.2  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 208 aa  45.4  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0683  XRE family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 239 aa  45.4  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  43.33 
 
 		 204 aa  45.4  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  38.89 
 
 		 181 aa  45.1  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  38.89 
 
 		 181 aa  45.1  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0874  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 206 aa  45.1  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000967944  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  38.89 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1434  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 433 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.673914  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 495 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  38.89 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  38.89 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  38.89 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  38.89 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 70 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  41.94 
 
 		 488 aa  44.3  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  31.46 
 
 		 182 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2242  helix-turn-helix domain-containing protein  37.1 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.453871 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2517  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 504 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 106 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0107  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 128 aa  43.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 490 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2198  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4719  transcriptional regulator, XRE family  38.96 
 
 		 86 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.155246 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 77 aa  43.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2087  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  32.81 
 
 		 180 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1916  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 128 aa  42.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1922  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 128 aa  43.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.243972  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 205 aa  42.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>