More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4755 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4755  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 
362 aa  721    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7134  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  73.7 
 
 
373 aa  519  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1411  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  72.02 
 
 
385 aa  476  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1425  histidine kinase  65.61 
 
 
392 aa  467  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.913373  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6029  histidine kinase  70.59 
 
 
367 aa  467  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.95 
 
 
375 aa  460  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.960828  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5789  histidine kinase  68.56 
 
 
405 aa  444  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689027  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4513  histidine kinase  61.77 
 
 
382 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0449708  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4943  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.77 
 
 
378 aa  288  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0519  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.89 
 
 
378 aa  244  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2297  histidine kinase  36.46 
 
 
467 aa  202  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.465362 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  39.73 
 
 
413 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1628  histidine kinase  37.02 
 
 
425 aa  195  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.827591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6772  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.79 
 
 
448 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  35.79 
 
 
436 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  41.75 
 
 
343 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26830  signal transduction histidine kinase  47.11 
 
 
368 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863991  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25340  signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 
483 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.75 
 
 
416 aa  182  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.616197 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5938  histidine kinase  33.92 
 
 
400 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
395 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907566  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 
426 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.801726  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
400 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1497  ATPase domain-containing protein  38.83 
 
 
389 aa  169  7e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6644  histidine kinase  37.31 
 
 
391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157131 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1459  histidine kinase  37.8 
 
 
389 aa  166  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1033  histidine kinase  40.77 
 
 
403 aa  166  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4520  histidine kinase  38.8 
 
 
344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 
362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0081  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 
401 aa  162  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.5 
 
 
370 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3749  histidine kinase  37.16 
 
 
405 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0957761  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 
404 aa  156  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0471  histidine kinase  34.22 
 
 
370 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0153  histidine kinase  32.14 
 
 
398 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
473 aa  150  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333745  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.41 
 
 
435 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0409308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5650  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
394 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  37.37 
 
 
469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 
377 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  29.73 
 
 
461 aa  134  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
490 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 
469 aa  132  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 
487 aa  129  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
469 aa  126  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
498 aa  125  8.000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
504 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
524 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  31.53 
 
 
592 aa  123  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  27.59 
 
 
386 aa  122  7e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
469 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
515 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 
420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 
436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4934  histidine kinase  33.22 
 
 
515 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8630  histidine kinase  38.33 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  33.44 
 
 
506 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 
455 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  29.51 
 
 
503 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  31.39 
 
 
466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  25.63 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  31.51 
 
 
477 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  31.33 
 
 
379 aa  116  7.999999999999999e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3215  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
433 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  34.75 
 
 
438 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  34.75 
 
 
438 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  34.75 
 
 
438 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.21 
 
 
433 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  34.75 
 
 
438 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  34.75 
 
 
438 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  34.75 
 
 
438 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  34.75 
 
 
438 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0050  histidine kinase  32.86 
 
 
455 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  30.88 
 
 
583 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
513 aa  113  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  30.82 
 
 
486 aa  113  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1451  histidine kinase  33.33 
 
 
440 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  34.88 
 
 
438 aa  112  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
467 aa  112  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  35.13 
 
 
476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0023  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 
466 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
469 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
480 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2439  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
537 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230044  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
467 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  34.62 
 
 
438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 
413 aa  110  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 
467 aa  110  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  30.61 
 
 
436 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3336  two component sensor kinase  34.01 
 
 
473 aa  109  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  31.29 
 
 
487 aa  109  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>