71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4737 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4737  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  387  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.959543  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1727  transcriptional regulator, TetR family  49.74 
 
 		 197 aa  181  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0492221  normal  0.584646 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2514  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6683  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2069  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  41.59 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3084  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.634756  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  31.25 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2784  putative transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495892 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3831  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.484216  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5057  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1470  putative transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596057  normal  0.840694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2431  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1300  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.480052 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4496  hypothetical protein  27.37 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4621  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 216 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 217 aa  51.2  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4387  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 280 aa  48.5  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2806  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 193 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00749048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  28.81 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 260 aa  45.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2002  putative transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 232 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341745  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  32.41 
 
 		 201 aa  44.7  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 192 aa  44.7  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 346 aa  43.5  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 168 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 244 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  38.18 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  40.38 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 231 aa  42.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 200 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1620  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 214 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 227 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 203 aa  42  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 207 aa  42  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 227 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  38.46 
 
 		 195 aa  41.6  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 245 aa  41.6  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 239 aa  41.6  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 193 aa  41.6  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 245 aa  41.6  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 220 aa  41.2  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  38.46 
 
 		 202 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 203 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 203 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  38.46 
 
 		 202 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  38.46 
 
 		 195 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  33.75 
 
 		 206 aa  41.2  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  38.46 
 
 		 195 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 203 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3208  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 204 aa  41.2  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.443054  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  38.46 
 
 		 195 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  38.46 
 
 		 195 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  38.46 
 
 		 202 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>