More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4713 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4713  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  100 
 
 
414 aa  843    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3562  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  36.87 
 
 
409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7081  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  37.04 
 
 
407 aa  230  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4246  Extracellular ligand-binding receptor  35.81 
 
 
409 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1738  leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  35.28 
 
 
409 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0827731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4245  ABC transporter substrate-binding protein  36.19 
 
 
410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1740  extracellular ligand-binding receptor  35.81 
 
 
435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.157953 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2001  Extracellular ligand-binding receptor  34.95 
 
 
411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3566  extracellular ligand-binding receptor  34.68 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172998  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0752  extracellular ligand-binding receptor  35.47 
 
 
405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284007  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0432  Extracellular ligand-binding receptor  35.53 
 
 
412 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290998  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1898  extracellular ligand-binding receptor  34.95 
 
 
411 aa  212  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.193262 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3265  twin-arginine translocation pathway signal  34.17 
 
 
407 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7650  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.34 
 
 
395 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7080  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  34.5 
 
 
404 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7651  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.41 
 
 
415 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99279  normal  0.165016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0583  Extracellular ligand-binding receptor  36.77 
 
 
406 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.981919  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1739  extracellular ligand-binding receptor  33.76 
 
 
410 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.152869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7082  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  33.99 
 
 
407 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3559  extracellular ligand-binding receptor  32.93 
 
 
418 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0888701  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3560  extracellular ligand-binding receptor  33.5 
 
 
411 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4103  extracellular ligand-binding receptor  35.54 
 
 
401 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742112  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1005  extracellular ligand-binding receptor  32.63 
 
 
407 aa  203  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4244  Extracellular ligand-binding receptor  33.6 
 
 
411 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4823  extracellular ligand-binding receptor  36.24 
 
 
437 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4000  Extracellular ligand-binding receptor  33.6 
 
 
403 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2248  Extracellular ligand-binding receptor  33.69 
 
 
410 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0038  extracellular ligand-binding receptor  36.08 
 
 
406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4394  extracellular ligand-binding receptor  38.03 
 
 
406 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1842  hypothetical protein  33.33 
 
 
405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0666  ABC transporter substrate-binding protein  32 
 
 
410 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.112312 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3561  extracellular ligand-binding receptor  32.11 
 
 
409 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3339  extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 
410 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.154352  normal  0.135284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5294  putative ABC-type branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  36.44 
 
 
406 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4684  extracellular ligand-binding receptor  36.7 
 
 
406 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0121  extracellular ligand-binding receptor  34.04 
 
 
406 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0352  extracellular ligand-binding receptor  32.1 
 
 
410 aa  184  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0110  putative ABC transporter, substrate-binding protein; putative branched-chain amino acid transporter  29.75 
 
 
402 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64006  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3633  Extracellular ligand-binding receptor  31.05 
 
 
402 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4650  putative ABC transporter (substrate-binding protein); putative branched-chain amino acid transporter  30.03 
 
 
400 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0801  putative amino-acid ABC transport system, periplasmic binding protein  29.84 
 
 
409 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350264  normal  0.0350726 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0874  putative amino-acid ABC transport system, periplasmic binding protein  28.37 
 
 
406 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.034766  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22980  amino acid-binding protein  32.8 
 
 
434 aa  156  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0512293  normal  0.104714 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0796  extracellular ligand-binding receptor  26.46 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4614  extracellular ligand-binding receptor  27.39 
 
 
406 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5154  putative branched-chain amino acid ABC transport system substrate-binding protein  28.53 
 
 
399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210774  normal  0.0422274 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4590  Extracellular ligand-binding receptor  28.99 
 
 
441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1779  hypothetical protein  29.33 
 
 
438 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1428  Extracellular ligand-binding receptor  26.24 
 
 
401 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2791  Extracellular ligand-binding receptor  26.94 
 
 
436 aa  97.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal  0.125183 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  23.31 
 
 
386 aa  97.4  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  25.59 
 
 
408 aa  97.1  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  27.46 
 
 
403 aa  97.1  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  30.47 
 
 
386 aa  95.5  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  30.66 
 
 
398 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  28.02 
 
 
411 aa  93.6  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  28.13 
 
 
379 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2733  Extracellular ligand-binding receptor  28.16 
 
 
407 aa  90.5  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.38 
 
 
425 aa  90.9  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  28.02 
 
 
411 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  26.12 
 
 
377 aa  90.1  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0299  extracellular ligand-binding receptor  26.58 
 
 
378 aa  86.7  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3504  extracellular ligand-binding receptor  26.39 
 
 
392 aa  86.7  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0407454  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  26.1 
 
 
480 aa  86.7  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  27.9 
 
 
385 aa  86.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  27.32 
 
 
388 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3009  extracellular ligand-binding receptor  26.91 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000545529  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  29.9 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  27.99 
 
 
387 aa  82.8  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  31.91 
 
 
384 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  29.45 
 
 
385 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  28.74 
 
 
382 aa  81.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  27.34 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  29.45 
 
 
385 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.78 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  24.89 
 
 
389 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  36.8 
 
 
378 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3166  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  28.16 
 
 
423 aa  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0130839  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.82 
 
 
378 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0953  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 
426 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  27.71 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0479  extracellular ligand-binding receptor  24.91 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  23.03 
 
 
472 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  29.31 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  25.58 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  28.33 
 
 
382 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  27.41 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0446  Extracellular ligand-binding receptor  25.74 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1828  hypothetical protein  23.55 
 
 
539 aa  74.3  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00860183  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2499  twin-arginine translocation pathway signal  28.47 
 
 
407 aa  73.9  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  27.74 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  37.82 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0963  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  25.47 
 
 
517 aa  73.2  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  26.78 
 
 
386 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 
379 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  24.08 
 
 
400 aa  72.8  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4876  extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 
378 aa  72  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.983185  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  27.16 
 
 
380 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3597  extracellular ligand-binding receptor  36.18 
 
 
398 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>