173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4689 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  100 
 
 		 177 aa  345  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  41.42 
 
 		 168 aa  110  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  37.57 
 
 		 210 aa  94.4  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  38.42 
 
 		 183 aa  85.1  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  35.12 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  37.2 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 170 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  33.14 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  32.94 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  35.15 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4160  transcriptional regulator, PadR-like family  33.14 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354182  normal  0.0431624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  32.95 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4806  transcriptional regulator, PadR-like family  33.73 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  32.86 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0701  transcriptional regulator, PadR-like family  34.25 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  35.22 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1343  transcriptional regulator PadR family protein  32.67 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  31.74 
 
 		 174 aa  62  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  32.1 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06230  predicted transcriptional regulator  33.14 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.946193  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  32.34 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  29.82 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  33.73 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  34.91 
 
 		 198 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  30.22 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  39.53 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4729  transcriptional regulator, PadR-like family  32.26 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  34.94 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  42.22 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1561  transcriptional regulator, PadR-like family  41.18 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  32.35 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  28.65 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4818  transcriptional regulator, PadR-like family  30.6 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3741  transcriptional regulator, PadR-like family  30.6 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05461  hypothetical protein  32.5 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.144264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 220 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  30.23 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  34.91 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  33.14 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  25 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3177  transcriptional regulator, PadR-like family  31.25 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.556918  normal  0.03966 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3646  transcriptional regulator, PadR-like family  28.07 
 
 		 199 aa  52  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 181 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  38.54 
 
 		 129 aa  52.4  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000122824  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 181 aa  51.6  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  26.44 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  37.65 
 
 		 252 aa  51.6  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0057  transcriptional regulator, PadR-like family  41.38 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  38.64 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  31.52 
 
 		 218 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  30.63 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  27.98 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  34.56 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  40.23 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  32.53 
 
 		 232 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5591  PadR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  24.46 
 
 		 325 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  36.47 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4824  transcriptional regulator, PadR-like family  35.64 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  36.67 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  34.48 
 
 		 110 aa  48.5  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  29.63 
 
 		 212 aa  48.1  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  42.17 
 
 		 250 aa  48.1  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 229 aa  48.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  28.45 
 
 		 215 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 187 aa  47.8  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  22.39 
 
 		 183 aa  47.8  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1958  transcriptional regulator, PadR-like family  28.98 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  26.81 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  30.67 
 
 		 205 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  25.28 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  42.68 
 
 		 123 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0095  PadR-like family regulatory protein  33.61 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  33.61 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1600  PadR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797294  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1517  PadR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13740  predicted transcriptional regulator  24.86 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>