More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4617 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4617  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
296 aa  592  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3232  transcriptional regulator, AraC family  63.85 
 
 
296 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0599312  hitchhiker  0.0000105754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  33.21 
 
 
303 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  29.43 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  32.37 
 
 
307 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 
316 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5716  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 
304 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 
361 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  34.97 
 
 
296 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  36.55 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  45.92 
 
 
281 aa  89.7  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  28.64 
 
 
318 aa  89.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  30.99 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  43.56 
 
 
261 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  37.42 
 
 
300 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 
304 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  25.53 
 
 
309 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  44.21 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 
265 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  28.09 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2693  helix-turn-helix domain-containing protein  44.68 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.129803  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  43.43 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  30.15 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  29.31 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  30.81 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7015  AraC family transcriptional regulator  28.36 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1480  AraC family transcriptional regulator  27.99 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6349  AraC family transcriptional regulator  27.99 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502154  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 
353 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 
519 aa  79  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  47.67 
 
 
142 aa  79  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  26.87 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 
349 aa  78.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  36.15 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  28.35 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  39.36 
 
 
156 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2282  putative transcriptional regulator  26.09 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  42.74 
 
 
305 aa  77  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  28.11 
 
 
291 aa  77  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  41.84 
 
 
250 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6861  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133867  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23500  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  41.41 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  45.35 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  27.75 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  45.35 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0193  AraC family transcriptional regulator  27.23 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  36.69 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  39.34 
 
 
279 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4066  transcriptional activator RhaS  40.78 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.828841  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28660  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  42.31 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  28.5 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2488  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 
316 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2695  transcriptional regulator, AraC family  35.45 
 
 
344 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  32.88 
 
 
322 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  44.79 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 
154 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  47.73 
 
 
157 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2406  transcriptional regulator, AraC family  34.11 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2152  transcriptional regulator, AraC family  34.11 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.49496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  40.45 
 
 
372 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  43.62 
 
 
140 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3975  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4377  transcriptional activator RhaS  33.11 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  26.81 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  38.1 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3689  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  39.25 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  27.98 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  22.86 
 
 
538 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  43.62 
 
 
150 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  43.62 
 
 
150 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  43.62 
 
 
150 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2590  transcriptional regulator AraC family  32.86 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1619  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.36 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0667714  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4291  transcriptional activator RhaS  37.5 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3394  transcriptional regulator, AraC family  34.56 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4331  transcriptional activator RhaS  37.5 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0197402 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4443  transcriptional activator RhaS  37.14 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0347  transcriptional regulator, AraC family  35.51 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  41.49 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  42.55 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5827  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5610  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00190409  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  40.45 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  33.74 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  34.65 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  41.86 
 
 
168 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>