More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4614 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  100 
 
 		 919 aa  1829    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  47.51 
 
 		 924 aa  746    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  50.57 
 
 		 1357 aa  627  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  47.78 
 
 		 1217 aa  544  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  41.33 
 
 		 1211 aa  538  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  49.74 
 
 		 1557 aa  531  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  34.37 
 
 		 1363 aa  492  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  40.14 
 
 		 1163 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  39.07 
 
 		 1652 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  33.2 
 
 		 947 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  48.8 
 
 		 696 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.34 
 
 		 1481 aa  442  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  39.7 
 
 		 1510 aa  436  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 1221 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  43.62 
 
 		 1523 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  41.09 
 
 		 1553 aa  439  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  40.2 
 
 		 1789 aa  439  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  40.52 
 
 		 1344 aa  427  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  43 
 
 		 1196 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  36.91 
 
 		 1236 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.87 
 
 		 1686 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  34.78 
 
 		 1229 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  39.76 
 
 		 1193 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  42.16 
 
 		 1364 aa  394  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  39.12 
 
 		 1661 aa  389  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  37.99 
 
 		 1656 aa  389  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  38.96 
 
 		 1474 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  34.6 
 
 		 943 aa  373  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.98 
 
 		 1711 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  38.35 
 
 		 1188 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  40.54 
 
 		 1454 aa  369  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  43.05 
 
 		 1443 aa  366  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  37.94 
 
 		 1657 aa  362  3e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  38.1 
 
 		 1367 aa  359  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.78 
 
 		 1760 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  36.06 
 
 		 1334 aa  358  3.9999999999999996e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  38.45 
 
 		 1190 aa  357  5e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  35.88 
 
 		 1552 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.54 
 
 		 1262 aa  354  4e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  34.67 
 
 		 1831 aa  348  4e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  49.14 
 
 		 1240 aa  340  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.07 
 
 		 930 aa  339  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  34.36 
 
 		 1247 aa  338  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  34.07 
 
 		 1213 aa  331  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  28.66 
 
 		 1348 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  33.33 
 
 		 1868 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.36 
 
 		 1598 aa  329  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  34.85 
 
 		 1714 aa  327  6e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  57.99 
 
 		 675 aa  327  8.000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  35.63 
 
 		 1399 aa  323  8e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  37.46 
 
 		 1901 aa  323  8e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.24 
 
 		 1583 aa  322  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  33.02 
 
 		 1176 aa  321  3e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.54 
 
 		 1609 aa  313  7.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  31.89 
 
 		 1177 aa  313  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.56 
 
 		 1684 aa  312  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  32.3 
 
 		 1161 aa  311  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  32.46 
 
 		 1161 aa  311  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  33.65 
 
 		 1208 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  54.46 
 
 		 716 aa  303  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  36.52 
 
 		 1807 aa  302  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  30.24 
 
 		 1304 aa  301  4e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.99 
 
 		 1547 aa  300  7e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  30.22 
 
 		 1491 aa  298  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.41 
 
 		 1607 aa  296  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  36.1 
 
 		 1416 aa  296  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  34.36 
 
 		 1242 aa  295  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  32.52 
 
 		 1411 aa  292  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  54.26 
 
 		 737 aa  289  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.42 
 
 		 1599 aa  290  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.13 
 
 		 1617 aa  284  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  28.66 
 
 		 1188 aa  283  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  31.44 
 
 		 1858 aa  283  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.59 
 
 		 1626 aa  281  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  32.07 
 
 		 1330 aa  279  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  34.38 
 
 		 1209 aa  277  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  34.32 
 
 		 608 aa  272  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  33.83 
 
 		 1214 aa  272  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  50.31 
 
 		 405 aa  271  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  34.6 
 
 		 1183 aa  269  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  41.54 
 
 		 1267 aa  269  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  24.61 
 
 		 1016 aa  267  7e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  41.16 
 
 		 1599 aa  266  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  29.04 
 
 		 1164 aa  265  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  31.27 
 
 		 1311 aa  264  4.999999999999999e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.47 
 
 		 1623 aa  263  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  24.41 
 
 		 1016 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  36.67 
 
 		 1766 aa  261  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.35 
 
 		 1856 aa  259  2e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  50.64 
 
 		 652 aa  259  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  30.27 
 
 		 728 aa  258  4e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.81 
 
 		 1823 aa  253  8.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  54.34 
 
 		 540 aa  253  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  25.48 
 
 		 1373 aa  251  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  31.74 
 
 		 1209 aa  248  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  45.35 
 
 		 682 aa  247  9e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  45.83 
 
 		 344 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  31.06 
 
 		 1264 aa  243  9e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  31.06 
 
 		 1264 aa  243  9e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  45.54 
 
 		 344 aa  242  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>