More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4585 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4585  putative membrane transport protein  100 
 
 		 403 aa  770    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00668253  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0534  hypothetical protein  48.34 
 
 		 412 aa  332  7.000000000000001e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5551  major facilitator superfamily MFS_1  44.92 
 
 		 420 aa  289  6e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  37.09 
 
 		 432 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  34.51 
 
 		 429 aa  182  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  34.56 
 
 		 418 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 415 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 410 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  34.08 
 
 		 435 aa  136  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0805  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 459 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 		 442 aa  123  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0062  major facilitator superfamily protein  30.83 
 
 		 431 aa  123  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4528  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 409 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.392098 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1062  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4617  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117227  hitchhiker  0.000601374 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  28.84 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  28.84 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  25.87 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  25.6 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  25.33 
 
 		 420 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  25.07 
 
 		 420 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  25.33 
 
 		 420 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  25.27 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  25.81 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  25.34 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2487  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000357828  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4925  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  27.43 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.64 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.64 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  22.42 
 
 		 412 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  28.87 
 
 		 443 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2682  permease, putative  24.33 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193571  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  30.08 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2468  permease  23.45 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000564968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  26.39 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2649  permease  23.45 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.765576  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2432  permease  23.62 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0771594  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0867  putative membrane transport protein  31.52 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2667  putative permease  23.62 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524828 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 433 aa  69.7  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1625  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.568704  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4887  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 524 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  30.55 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2393  permease; macrolide-efflux protein  22.8 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.366369  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  22.4 
 
 		 410 aa  67  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  22.72 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  21.22 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  21.22 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  20.73 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  24.13 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  24.87 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1339  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1531  hypothetical protein  23.16 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1650  hypothetical protein  23.16 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1505  permease; multidrug resistance protein  23.16 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0948022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2678  MFS family major facilitator transporter  23.24 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.1 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14790  Major Facilitator Superfamily transporter  28.06 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4752  major facilitator superfamily MFS_1  35.05 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2720  putative permease  22.8 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.093304  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 461 aa  63.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  27.8 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  27.8 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0092  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.031642  normal  0.214383 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 413 aa  62.8  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1717  hypothetical protein  22.65 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 413 aa  62.8  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  20.73 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  23.47 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>