53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4545 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  44.83 
 
 		 182 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  41.86 
 
 		 183 aa  137  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 		 243 aa  94.7  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  35.03 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 		 214 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  32.34 
 
 		 197 aa  88.2  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.94 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  55.56 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  33.86 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  34.07 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  51.76 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  52.78 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  29.55 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  47.5 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  57.58 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  32.61 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  33.91 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  33.69 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  32.11 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  30 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  32.57 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  32.42 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  31.21 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  40.28 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  28.57 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  41.25 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  30.93 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  43.02 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  28.92 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  37 
 
 		 186 aa  48.5  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  27.47 
 
 		 171 aa  47.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 226 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0607  hypothetical protein  35.85 
 
 		 205 aa  44.7  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1057  transcriptional regulator, ArsR family  47.54 
 
 		 111 aa  44.7  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.543137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  44.7  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  32.05 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0746  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2809  hypothetical protein  37.18 
 
 		 249 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4536  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 224 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482904  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0866  transcriptional regulator, ArsR family  40.98 
 
 		 104 aa  42  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.980203 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 207 aa  42  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1011  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 207 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1080  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 207 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0109  ArsR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 197 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>