53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4536 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4536  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
224 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482904  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0618  regulatory protein, ArsR  68.81 
 
 
210 aa  267  8.999999999999999e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0746  transcriptional regulator, ArsR family  69 
 
 
210 aa  265  5.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2809  hypothetical protein  72.45 
 
 
249 aa  251  7e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0212  regulatory protein ArsR  67.01 
 
 
201 aa  244  9e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1111  putative transcriptional regulator  69.31 
 
 
223 aa  240  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0673626  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0328  putative transcriptional regulator  64.74 
 
 
201 aa  233  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2299  regulatory protein, ArsR  57.89 
 
 
196 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.718193  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2853  putative transcriptional regulator  59.47 
 
 
193 aa  198  7e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  decreased coverage  0.00327558 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0404  hypothetical protein  58.12 
 
 
197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.748136 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0395  hypothetical protein  58.12 
 
 
197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0383  hypothetical protein  58.12 
 
 
197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1399  hypothetical protein  55.79 
 
 
192 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.104773  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0607  hypothetical protein  39.8 
 
 
205 aa  114  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 
196 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0996  hypothetical protein  38.42 
 
 
224 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4628  hypothetical protein  42.86 
 
 
200 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2552  ArsR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
185 aa  72  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0674571  normal  0.191331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7611  ArsR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
185 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
207 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2973  putative transcriptional regulator  31.88 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226444  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  29.35 
 
 
150 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3245  transcriptional regulator, ArsR family  32.35 
 
 
208 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0109  ArsR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
197 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0045  transcriptional regulator, ArsR family  29.07 
 
 
142 aa  54.7  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3009  ArsR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3257  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
207 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3255  transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 
207 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2946  ArsR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
207 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.958799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3024  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
207 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3275  transcriptional regulator, ArsR family  30.16 
 
 
184 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.42483  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  27.92 
 
 
200 aa  48.9  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  27.59 
 
 
472 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5282  hypothetical protein  29.57 
 
 
180 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  45.45 
 
 
196 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  40.68 
 
 
214 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 
171 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  26.13 
 
 
213 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1497  transcriptional regulator  30 
 
 
149 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1739  hypothetical protein  27.27 
 
 
149 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0385114  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1606  transcriptional regulatory protein, putative  31.03 
 
 
188 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00436475  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1887  putative transcriptional regulatory protein  31.03 
 
 
188 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.471019  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1526  putative transcriptional regulator  26.97 
 
 
180 aa  43.5  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  35 
 
 
232 aa  43.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
187 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
186 aa  42.4  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1506  ArsR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
149 aa  42.4  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0520742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1651  hypothetical protein  27.78 
 
 
149 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1532  hypothetical protein  27.78 
 
 
149 aa  42.4  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.21 
 
 
243 aa  42  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  48.89 
 
 
115 aa  42  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1718  hypothetical protein  27.78 
 
 
149 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>