More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4525 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 160 aa  320  4e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  37.21 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  38.13 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  43.8 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  40.18 
 
 		 287 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  40.71 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  35.77 
 
 		 153 aa  67  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  39.82 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 219 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  42.27 
 
 		 292 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  29.75 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  37.61 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  37.14 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0560  transcriptional regulator, MarR family  40.37 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  40.4 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  36.63 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  39.02 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  39.02 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6941  transcriptional regulator, MarR family  43.88 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  44.74 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  35.14 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>