89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4494 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4494  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 343 aa  674    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1404  saccharopine dehydrogenase  66.08 
 
 		 344 aa  451  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3474  saccharopine dehydrogenase  47.4 
 
 		 351 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5296  saccharopine dehydrogenase  46.24 
 
 		 351 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.813788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6607  saccharopine dehydrogenase  34.9 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  27.45 
 
 		 351 aa  99.4  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1054  hypothetical protein  30.8 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1149  hypothetical protein  30.8 
 
 		 351 aa  90.5  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3058  saccharopine dehydrogenase  39.25 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56730  hypothetical protein  27.22 
 
 		 352 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1135  Saccharopine dehydrogenase  31.4 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  30.71 
 
 		 363 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  36.51 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4933  hypothetical protein  39.2 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1643  saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2316  Saccharopine dehydrogenase  35.15 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3672  saccharopine dehydrogenase  36.2 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.420648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  28.5 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  26.77 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3544  putative integral membrane protein  27.01 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2359  Saccharopine dehydrogenase  28.91 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0263338  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  30.81 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4206  saccharopine dehydrogenase  33.77 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1339  Saccharopine dehydrogenase  35.5 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0176  hypothetical protein  29.14 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  35.43 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1361  Saccharopine dehydrogenase  33.65 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2873  saccharopine dehydrogenase  39.22 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0514  saccharopine dehydrogenase  28.39 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3887  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  37.59 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0138  saccharopine dehydrogenase  31.37 
 
 		 432 aa  59.7  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3185  Saccharopine dehydrogenase  36 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418477  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4124  Saccharopine dehydrogenase  25.28 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3084  Saccharopine dehydrogenase  36 
 
 		 352 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3626  saccharopine dehydrogenase  31.34 
 
 		 410 aa  57  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0316  saccharopine dehydrogenase  36.88 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.424303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2140  saccharopine dehydrogenase  36.36 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0726  Saccharopine dehydrogenase  31.34 
 
 		 421 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  35.71 
 
 		 454 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3455  saccharopine dehydrogenase  35.04 
 
 		 378 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.750747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0783  saccharopine dehydrogenase  26.71 
 
 		 388 aa  53.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0129  hypothetical protein  28.43 
 
 		 432 aa  53.5  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.150233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1105  Saccharopine dehydrogenase  31.37 
 
 		 422 aa  53.1  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4764  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  36.96 
 
 		 410 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1653  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  33.58 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173557  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0020  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  27.39 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  26.65 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  24.54 
 
 		 367 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2746  saccharopine dehydrogenase  29.05 
 
 		 377 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000611807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6392  saccharopine dehydrogenase:NmrA-like  27.52 
 
 		 377 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370059  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07293  conserved hypothetical protein  23.81 
 
 		 430 aa  50.1  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.087222 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  26.05 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  23.74 
 
 		 378 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_41409  predicted protein  22.7 
 
 		 1506 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.974379  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  25.62 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  28.99 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3559  saccharopine dehydrogenase  27.82 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.924034  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  29.58 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3632  saccharopine dehydrogenase  27.82 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.288883 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3564  saccharopine dehydrogenase  27.82 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.39 
 
 		 200 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0538  saccharopine dehydrogenase  31.85 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2300  Saccharopine dehydrogenase  33.33 
 
 		 408 aa  47.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0134168  hitchhiker  0.00267876 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3229  Saccharopine dehydrogenase  31.06 
 
 		 405 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0356215 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4354  saccharopine dehydrogenase  24.83 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5035  saccharopine dehydrogenase  26.21 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5825  saccharopine dehydrogenase  26.21 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  23.96 
 
 		 384 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01040  Saccharopine dehydrogenase  26.47 
 
 		 391 aa  46.6  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.96 
 
 		 271 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725302  normal  0.780103 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12850  hypothetical protein  31.48 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1613  hypothetical protein  42.19 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.899214  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6092  saccharopine dehydrogenase  26.28 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0147  saccharopine dehydrogenase  28.36 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5854  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  26.28 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0612  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  28.03 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.81 
 
 		 377 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00494367  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32292  predicted protein  27.94 
 
 		 502 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355171  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40135  predicted protein  28.74 
 
 		 461 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0390  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2468  saccharopine dehydrogenase  31.85 
 
 		 392 aa  43.5  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1374  hypothetical protein  42.42 
 
 		 346 aa  43.5  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.920044  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0528  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  26.11 
 
 		 414 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16272  predicted protein  25.32 
 
 		 498 aa  43.5  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  34.15 
 
 		 283 aa  43.5  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3396  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  27.74 
 
 		 389 aa  43.1  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.705544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4278  saccharopine dehydrogenase  29.85 
 
 		 388 aa  43.1  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1467  saccharopine dehydrogenase  27.86 
 
 		 413 aa  43.1  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.071229  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2454  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 		 320 aa  42.7  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>