92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4476 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 
731 aa  1498    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  38.4 
 
 
463 aa  308  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  37.94 
 
 
490 aa  303  6.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  38.03 
 
 
482 aa  293  7e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  39.41 
 
 
471 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  39.58 
 
 
478 aa  288  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  41.74 
 
 
446 aa  287  4e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  40.87 
 
 
446 aa  283  8.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48865  predicted protein  38.14 
 
 
500 aa  246  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  34.04 
 
 
466 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  34.26 
 
 
464 aa  240  9e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  35.93 
 
 
473 aa  235  3e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  32.85 
 
 
532 aa  228  4e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  33.13 
 
 
484 aa  224  4e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  32.64 
 
 
492 aa  214  3.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  31.51 
 
 
584 aa  214  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  31.4 
 
 
606 aa  214  7e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  32.01 
 
 
537 aa  210  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  32.57 
 
 
515 aa  206  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  29.26 
 
 
534 aa  205  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  32.27 
 
 
505 aa  204  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  35.11 
 
 
474 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  32.02 
 
 
798 aa  199  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  30.88 
 
 
495 aa  191  5e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  31.98 
 
 
663 aa  188  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  33.09 
 
 
408 aa  186  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  33.59 
 
 
435 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  32.92 
 
 
464 aa  181  4.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  29.52 
 
 
479 aa  179  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1541  Alpha-L-fucosidase  29.33 
 
 
516 aa  178  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4241  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L- fucosidase)  28.9 
 
 
555 aa  174  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.525329  normal  0.717793 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  32.55 
 
 
441 aa  170  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  32.29 
 
 
473 aa  167  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  31.46 
 
 
431 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  29.6 
 
 
446 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  33.25 
 
 
452 aa  163  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  29.41 
 
 
429 aa  163  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2072  Alpha-L-fucosidase  28.48 
 
 
486 aa  162  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  30.89 
 
 
435 aa  161  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4875  Alpha-L-fucosidase  30.7 
 
 
483 aa  160  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185578  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  27.45 
 
 
471 aa  158  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  33.61 
 
 
538 aa  157  9e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  30.4 
 
 
440 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  30.57 
 
 
479 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  52.08 
 
 
818 aa  154  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  29.21 
 
 
415 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  29.53 
 
 
429 aa  152  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  26.89 
 
 
485 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1302  glycoside hydrolase family alpha-L-fucosidase  25.65 
 
 
540 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.186001 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  31.09 
 
 
596 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  31.74 
 
 
627 aa  144  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  30.85 
 
 
581 aa  141  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  25.51 
 
 
479 aa  140  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  28.61 
 
 
445 aa  137  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  28.63 
 
 
494 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  28.66 
 
 
473 aa  135  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  28.88 
 
 
711 aa  125  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  29.79 
 
 
644 aa  121  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  37.18 
 
 
212 aa  120  7e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1997  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.47 
 
 
541 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  26.96 
 
 
447 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  24.34 
 
 
450 aa  106  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  26.88 
 
 
340 aa  99.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  25 
 
 
478 aa  97.4  8e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  26.12 
 
 
674 aa  96.3  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  25.47 
 
 
474 aa  92.4  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  51.47 
 
 
1171 aa  71.6  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  45.24 
 
 
1390 aa  68.9  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25537  predicted protein  30.07 
 
 
2136 aa  68.9  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0834467  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2732  methyltransferase FkbM family  39.35 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  27.59 
 
 
463 aa  65.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  27.78 
 
 
470 aa  62.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  34.07 
 
 
932 aa  59.3  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  33.33 
 
 
750 aa  58.2  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.97 
 
 
698 aa  58.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  36.03 
 
 
690 aa  57.8  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  27.08 
 
 
410 aa  56.6  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2733  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.86 
 
 
778 aa  55.1  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  26.67 
 
 
460 aa  53.5  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.32 
 
 
688 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0983  FkbM family methyltransferase  31.98 
 
 
416 aa  52.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171365  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  26.32 
 
 
460 aa  52  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  32.59 
 
 
704 aa  51.6  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.46 
 
 
687 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  25.98 
 
 
434 aa  50.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.69 
 
 
1109 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  23.88 
 
 
606 aa  48.1  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.59 
 
 
704 aa  47.8  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3849  hypothetical protein  30.41 
 
 
509 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.430064 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.17 
 
 
467 aa  47.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.86 
 
 
487 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.63 
 
 
709 aa  46.6  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>