142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4407 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  100 
 
 		 176 aa  347  7e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  63.01 
 
 		 183 aa  228  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  64.37 
 
 		 177 aa  225  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  49.42 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  30.98 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  36.76 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  30.22 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  43.21 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  34.19 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  34.45 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  31.71 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  50.91 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  41.77 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  43.75 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  41.38 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 272 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  40 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  38.37 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  42.67 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  42.31 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  40.23 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  32.33 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  49.06 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  39.47 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  35.14 
 
 		 112 aa  52.8  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  35.8 
 
 		 118 aa  52.4  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1680  transcriptional regulator, PadR-like family  32.5 
 
 		 107 aa  52  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  34.62 
 
 		 111 aa  50.8  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  22.52 
 
 		 165 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5375  PadR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5464  PadR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5751  PadR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2071  PadR-like family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 112 aa  50.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202752  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  22.52 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 108 aa  49.3  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3449  hypothetical protein  32.47 
 
 		 106 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000660793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3242  hypothetical protein  32.47 
 
 		 106 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.758669  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3215  PadR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 106 aa  48.5  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3152  PadR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 106 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3495  hypothetical protein  32.47 
 
 		 106 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3470  hypothetical protein  32.47 
 
 		 106 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3456  hypothetical protein  32.47 
 
 		 106 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  37.66 
 
 		 121 aa  48.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  23.03 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  23.03 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  23.03 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  23.03 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 112 aa  48.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 112 aa  48.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  23.84 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0894  transcriptional regulator PadR-like protein  37.5 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3441  hypothetical protein  31.17 
 
 		 106 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1805  hypothetical protein  31.17 
 
 		 106 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  22.42 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 108 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3150  PadR-like family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 106 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  27.66 
 
 		 109 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  37.66 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  31 
 
 		 106 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1858  PadR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 104 aa  45.4  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000789415  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 125 aa  45.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 103 aa  45.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3780  transcriptional regulator, PadR family  31.17 
 
 		 108 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0742647  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  27.85 
 
 		 109 aa  45.1  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  34.62 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 188 aa  44.7  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  30.86 
 
 		 124 aa  44.7  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 118 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 118 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 118 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 109 aa  44.3  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  24.14 
 
 		 109 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  30.77 
 
 		 107 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 121 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0895  transcriptional regulator PadR family protein  35.9 
 
 		 110 aa  43.9  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.036663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  35.9 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  36 
 
 		 108 aa  44.3  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  30.77 
 
 		 107 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  30.77 
 
 		 109 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  30.14 
 
 		 114 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  31.17 
 
 		 117 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  30.77 
 
 		 109 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  35 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 103 aa  43.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  30.77 
 
 		 107 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  29.73 
 
 		 119 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>