More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4400 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 301 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  61.06 
 
 		 316 aa  348  5e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  60.75 
 
 		 324 aa  321  8e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  59.04 
 
 		 301 aa  318  9e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  58.02 
 
 		 300 aa  276  4e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  53.24 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  49.49 
 
 		 308 aa  246  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  38.05 
 
 		 298 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 296 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  35.57 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  37.82 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  37.12 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  39.04 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  32.87 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 305 aa  146  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  39.84 
 
 		 311 aa  146  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  36.27 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 306 aa  145  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  38.95 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  37.91 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  36.45 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  40.2 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  35.85 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 328 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  35.45 
 
 		 333 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  36.82 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 314 aa  139  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  36.58 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 302 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  41.02 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 300 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  38.08 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 288 aa  135  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  37.75 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 292 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  35.79 
 
 		 331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  36.07 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  38.6 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  36.45 
 
 		 312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  35.38 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  38.19 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  34.24 
 
 		 308 aa  125  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  36 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  35.76 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  32.41 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  37.19 
 
 		 294 aa  122  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4246  transcriptional regulator, LysR family  36.21 
 
 		 295 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20222  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  37.04 
 
 		 350 aa  122  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  36.82 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8854  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 375 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  31.06 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3713  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 334 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  37.62 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  37.04 
 
 		 306 aa  115  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  36.27 
 
 		 311 aa  115  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 304 aa  115  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  30.16 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 313 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 292 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 298 aa  112  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.33 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5293  LysR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382002 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  32.13 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3722  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  30.87 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2616  transcriptional regulator, LysR family  35.31 
 
 		 306 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000734486  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  27.07 
 
 		 300 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  33.21 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4505  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1650  LysR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0898  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  26.42 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5567  tartrate utilization transcriptional regulator  32.71 
 
 		 305 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.879392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1252  transcriptional regulator, LysR family  29.47 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  23.99 
 
 		 298 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  31.71 
 
 		 343 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  28.03 
 
 		 314 aa  105  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4207  LysR substrate-binding protein  30.74 
 
 		 297 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>