More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4368 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 431 aa  817    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2356  major facilitator superfamily MFS_1  55.18 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2863  major facilitator superfamily MFS_1  53.32 
 
 		 445 aa  297  3e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  44.79 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  41.48 
 
 		 422 aa  245  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  37.5 
 
 		 415 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 		 449 aa  209  8e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  41.47 
 
 		 443 aa  208  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0425  major facilitator transporter  42.16 
 
 		 430 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 		 445 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  35.18 
 
 		 438 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0513  major facilitator transporter  42.09 
 
 		 430 aa  190  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000815548 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  34.98 
 
 		 447 aa  189  8e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0063  major facilitator superfamily protein  36.59 
 
 		 419 aa  186  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.586585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33800  Major Facilitator Superfamily transporter  36.03 
 
 		 505 aa  183  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.714924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  39.25 
 
 		 443 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  34.12 
 
 		 420 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  34.89 
 
 		 426 aa  179  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 423 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10460  Major Facilitator Superfamily transporter  36.91 
 
 		 450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0261  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 		 438 aa  171  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0905059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 443 aa  170  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3075  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 423 aa  169  8e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 426 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 422 aa  164  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3197  major facilitator superfamily MFS_1  36.52 
 
 		 427 aa  159  9e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000392196 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 410 aa  159  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  34.44 
 
 		 403 aa  159  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  34.63 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  33.07 
 
 		 415 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0499  major facilitator superfamily MFS_1  33.65 
 
 		 436 aa  156  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 423 aa  155  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 		 422 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 421 aa  150  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  34.16 
 
 		 440 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0850  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.427056  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  36.46 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 		 406 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  34.99 
 
 		 432 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  33.76 
 
 		 412 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 406 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  34.99 
 
 		 432 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  34.96 
 
 		 415 aa  145  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 409 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  32.36 
 
 		 415 aa  144  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 499 aa  144  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 524 aa  143  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  31.66 
 
 		 419 aa  143  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 415 aa  143  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 415 aa  142  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 418 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 408 aa  141  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  31.3 
 
 		 427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  31.95 
 
 		 408 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2480  major facilitator transporter  31.57 
 
 		 457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 		 416 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  32.49 
 
 		 454 aa  139  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 		 411 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  30.85 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  32 
 
 		 408 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  32 
 
 		 408 aa  138  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  32.49 
 
 		 404 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 415 aa  136  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2285  major facilitator superfamily transporter  34.07 
 
 		 455 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00827549  hitchhiker  0.000379074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  31.69 
 
 		 412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 		 479 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  31.81 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 403 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0279  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 418 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00357  drug:proton antiporter  30.63 
 
 		 410 aa  130  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 413 aa  129  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  32.75 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  30.15 
 
 		 399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  34.03 
 
 		 424 aa  127  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  37.98 
 
 		 424 aa  126  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  29.66 
 
 		 414 aa  126  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  30.69 
 
 		 410 aa  124  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  30.14 
 
 		 421 aa  122  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 411 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2818  hypothetical protein  30.33 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  32.25 
 
 		 360 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 451 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 		 406 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 420 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 429 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>