More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4360 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.65 
 
 
523 aa  642    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.8 
 
 
516 aa  661    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
520 aa  1048    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  62.2 
 
 
517 aa  649    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  62.23 
 
 
520 aa  631  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  61.61 
 
 
516 aa  634  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  44.33 
 
 
513 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  38.34 
 
 
465 aa  279  1e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.53 
 
 
510 aa  262  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  40.29 
 
 
467 aa  239  8e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  36.28 
 
 
470 aa  233  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  37.3 
 
 
527 aa  227  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  33.48 
 
 
586 aa  226  8e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.64 
 
 
521 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  35.68 
 
 
556 aa  224  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  36.75 
 
 
532 aa  223  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  30.02 
 
 
484 aa  219  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  37.59 
 
 
525 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  37.59 
 
 
525 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  37.59 
 
 
525 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  36.84 
 
 
527 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  35.76 
 
 
529 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  30.72 
 
 
484 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.72 
 
 
484 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  30.52 
 
 
484 aa  212  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  30.52 
 
 
484 aa  212  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  30.52 
 
 
484 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  30.52 
 
 
484 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  30.52 
 
 
484 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  30.52 
 
 
484 aa  210  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.13 
 
 
579 aa  206  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  37.44 
 
 
524 aa  206  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  30.41 
 
 
451 aa  202  8e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  31.15 
 
 
563 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.81 
 
 
518 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  37.38 
 
 
521 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.82 
 
 
528 aa  196  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  34.7 
 
 
550 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  33.61 
 
 
531 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  35.7 
 
 
520 aa  186  8e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.08 
 
 
534 aa  183  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.57 
 
 
557 aa  180  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  37.58 
 
 
540 aa  180  5.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  32.03 
 
 
552 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.88 
 
 
572 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  30.72 
 
 
584 aa  172  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  29.95 
 
 
534 aa  169  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.68 
 
 
564 aa  169  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.78 
 
 
568 aa  168  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  43.2 
 
 
572 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  29.5 
 
 
502 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  29.58 
 
 
459 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.69 
 
 
565 aa  161  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  29.37 
 
 
534 aa  161  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.62 
 
 
534 aa  161  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  34.46 
 
 
545 aa  160  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2187  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.32 
 
 
459 aa  160  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  28.72 
 
 
459 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  28.51 
 
 
554 aa  158  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  26.48 
 
 
559 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.23 
 
 
533 aa  156  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  29.77 
 
 
456 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.7 
 
 
457 aa  155  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  29.95 
 
 
531 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.09 
 
 
470 aa  154  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  28.81 
 
 
466 aa  154  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  30.41 
 
 
483 aa  154  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.68 
 
 
459 aa  154  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.57 
 
 
470 aa  153  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.09 
 
 
470 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  28.63 
 
 
531 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  28.86 
 
 
470 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 
462 aa  152  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.12 
 
 
531 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.6 
 
 
470 aa  151  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  31.81 
 
 
546 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  32.13 
 
 
527 aa  151  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.41 
 
 
470 aa  151  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  28.64 
 
 
470 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.64 
 
 
470 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.9 
 
 
464 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  28.64 
 
 
470 aa  150  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  29.33 
 
 
459 aa  150  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  28.64 
 
 
470 aa  150  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  29.14 
 
 
538 aa  150  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.64 
 
 
470 aa  149  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  29.33 
 
 
459 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  30.65 
 
 
532 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.55 
 
 
469 aa  148  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  28.74 
 
 
474 aa  148  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0705  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.48 
 
 
457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0795  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.24 
 
 
457 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442237  normal  0.447341 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.55 
 
 
469 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.35 
 
 
469 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.35 
 
 
467 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  28.35 
 
 
531 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  29.95 
 
 
499 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2120  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome), FAD/FMN-containing oxidoreductase  29.8 
 
 
457 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312623  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  27 
 
 
583 aa  144  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  28.34 
 
 
474 aa  143  7e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>