More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4341 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 210 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  61.06 
 
 		 212 aa  250  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8662  transcriptional regulator, TetR family  56.25 
 
 		 207 aa  220  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 220 aa  157  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1169  regulatory protein, TetR  40.72 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1039  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  37.32 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 325 aa  104  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2595  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000390458  hitchhiker  0.00180541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2744  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 214 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2788  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 214 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2774  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.783627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0691  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 218 aa  95.1  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.545949 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3693  regulatory protein TetR  34.54 
 
 		 216 aa  91.7  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000370458  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1030  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5762  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182054  normal  0.0696367 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2572  regulatory protein TetR  30.14 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3745  hypothetical protein  35.18 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239031  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3160  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  42.05 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 324 aa  54.7  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  34.78 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  58.33 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  48.39 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 332 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4551  regulatory protein TetR  26.84 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 280 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6337  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 273 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  43.28 
 
 		 264 aa  52.8  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5244  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5332  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.199817 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 243 aa  52.8  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5623  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.63347  normal  0.363092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 251 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.44 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.44 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.44 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.44 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.44 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  36.49 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2305  transcriptional regulator RutR  36.49 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 203 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  36.49 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>