235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4287 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  100 
 
 		 1194 aa  2323    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  47.71 
 
 		 514 aa  184  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  35.23 
 
 		 1344 aa  183  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.84 
 
 		 1481 aa  178  7e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  34.5 
 
 		 1357 aa  175  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  30.48 
 
 		 1073 aa  174  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0402  transcriptional regulator, CadC  31.53 
 
 		 1124 aa  172  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  29.58 
 
 		 1553 aa  170  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.38 
 
 		 1240 aa  167  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.32 
 
 		 1760 aa  167  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3444  WD-40 repeat protein  35.24 
 
 		 1308 aa  164  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  35.38 
 
 		 1699 aa  162  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0799  transcriptional regulator, CadC  30.45 
 
 		 1102 aa  162  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.63 
 
 		 1343 aa  162  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1793  transcriptional regulator, XRE family  34.11 
 
 		 901 aa  161  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03808  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  33.86 
 
 		 1265 aa  161  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1508  transcriptional regulator, CadC  30.09 
 
 		 1089 aa  159  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.76281  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.34 
 
 		 1686 aa  158  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1517  transcriptional regulator, CadC  30.09 
 
 		 1067 aa  158  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2838  transcriptional regulator, CadC  29.71 
 
 		 1075 aa  158  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.199766  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  32.94 
 
 		 1733 aa  158  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1544  transcriptional regulator, CadC  29.86 
 
 		 1089 aa  157  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1699  transcriptional regulator  30.47 
 
 		 1075 aa  157  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  32.58 
 
 		 1094 aa  156  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0276  WD-40 repeat-containing protein  34.17 
 
 		 994 aa  156  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1415  transcriptional regulator, CadC  30.07 
 
 		 1092 aa  155  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.931625  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  26.51 
 
 		 1236 aa  154  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.18 
 
 		 1547 aa  154  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.77 
 
 		 1609 aa  154  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  30.07 
 
 		 972 aa  154  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  29.69 
 
 		 1078 aa  153  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.1 
 
 		 1438 aa  153  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2647  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  29.77 
 
 		 1075 aa  152  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.15837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.86 
 
 		 1398 aa  152  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2167  serine/threonine protein kinase  33.03 
 
 		 973 aa  151  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.037734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2580  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  28.57 
 
 		 1063 aa  151  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2755  transcriptional regulator  29.55 
 
 		 1080 aa  151  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.647625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.76 
 
 		 1607 aa  150  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  34.02 
 
 		 1152 aa  150  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.68 
 
 		 1190 aa  148  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  34.14 
 
 		 1157 aa  147  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  32.03 
 
 		 1148 aa  146  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.86 
 
 		 1626 aa  146  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  30.43 
 
 		 1510 aa  145  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.2 
 
 		 1823 aa  145  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  27.24 
 
 		 902 aa  144  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.99 
 
 		 1711 aa  143  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  35.35 
 
 		 1355 aa  143  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  33.64 
 
 		 1334 aa  142  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1191  serine/threonine protein kinase  32.28 
 
 		 969 aa  142  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  32.28 
 
 		 969 aa  142  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  31.85 
 
 		 897 aa  141  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  31.75 
 
 		 885 aa  140  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  32.28 
 
 		 965 aa  140  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  33.02 
 
 		 1046 aa  137  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.13 
 
 		 1598 aa  137  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0372  serine/threonine protein kinase  27.83 
 
 		 1032 aa  137  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.904942 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0944  transcriptional regulatory protein-like protein  29.05 
 
 		 1131 aa  135  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0430  putative transcriptional regulator, CadC  31.17 
 
 		 1074 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1024  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1026 aa  131  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000341432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2159  serine/threonine protein kinase  32.13 
 
 		 1353 aa  131  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6551  serine/threonine protein kinase  32.28 
 
 		 1013 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285307 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01092  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 1092 aa  126  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3373  NB-ARC domain protein  37.73 
 
 		 992 aa  126  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.05 
 
 		 510 aa  125  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  32.21 
 
 		 1657 aa  124  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.07 
 
 		 1623 aa  125  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  28.26 
 
 		 958 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5262  hypothetical protein  26.43 
 
 		 1432 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435656  hitchhiker  0.00193947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.42 
 
 		 1599 aa  122  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29 
 
 		 1583 aa  120  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6182  serine/threonine protein kinase  32.3 
 
 		 1314 aa  120  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.33 
 
 		 1684 aa  116  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  30.48 
 
 		 1230 aa  115  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  33.87 
 
 		 1401 aa  110  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.33 
 
 		 1617 aa  110  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2525  serine/threonine protein kinase  28.89 
 
 		 947 aa  108  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0438712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3798  WD40 repeat, subgroup  30.02 
 
 		 1301 aa  108  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0928  serine/threonine protein kinase  29.04 
 
 		 1005 aa  107  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3825  serine/threonine protein kinase  28.76 
 
 		 1014 aa  106  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445982  normal  0.0369399 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1224 aa  105  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.13 
 
 		 1412 aa  104  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0174  hypothetical protein  31.46 
 
 		 787 aa  103  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2824  serine/threonine protein kinase  27.81 
 
 		 1020 aa  102  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.71 
 
 		 395 aa  101  9e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.69 
 
 		 390 aa  100  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.47 
 
 		 666 aa  100  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.49 
 
 		 524 aa  100  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2232  serine/threonine protein kinase  28.22 
 
 		 1085 aa  99  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  29.33 
 
 		 493 aa  97.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  26.52 
 
 		 1328 aa  95.1  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  28.54 
 
 		 959 aa  94.7  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.75 
 
 		 1267 aa  94.7  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3123  hypothetical protein  31.48 
 
 		 1392 aa  94.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  29.07 
 
 		 546 aa  93.6  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  26.46 
 
 		 501 aa  92.8  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.87 
 
 		 1181 aa  91.7  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  27.81 
 
 		 1399 aa  91.3  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  26.76 
 
 		 644 aa  88.2  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  26.93 
 
 		 838 aa  87.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>