79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4246 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2425  Cholesterol oxidase  66.48 
 
 		 543 aa  748    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939121  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5961  Cholesterol oxidase  73.9 
 
 		 546 aa  846    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4246  Cholesterol oxidase  100 
 
 		 547 aa  1118    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.191663 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30650  choline dehydrogenase-like flavoprotein  52.86 
 
 		 534 aa  538  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3535  Cholesterol oxidase  52.17 
 
 		 533 aa  520  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0069  cholesterol oxidase  41.88 
 
 		 534 aa  412  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2611  cholesterol oxidase  36.98 
 
 		 543 aa  270  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3356  cholesterol oxidase  37.45 
 
 		 544 aa  256  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3901  cholesterol oxidase  33.74 
 
 		 541 aa  244  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2399  Cholesterol oxidase  34.41 
 
 		 513 aa  242  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220854  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2810  cholesterol oxidase  36.51 
 
 		 543 aa  240  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4774  Cholesterol oxidase  32.73 
 
 		 530 aa  232  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0826  cholesterol oxidase  30.64 
 
 		 502 aa  233  1e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.492238  unclonable  0.0000140216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2398  Cholesterol oxidase  33.59 
 
 		 538 aa  217  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  27.84 
 
 		 533 aa  116  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.95 
 
 		 543 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.21 
 
 		 572 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.53 
 
 		 543 aa  91.3  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 		 547 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 		 564 aa  87.8  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0361  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.37 
 
 		 556 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  24.35 
 
 		 554 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 		 563 aa  83.6  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  25.71 
 
 		 622 aa  83.6  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  31.76 
 
 		 569 aa  81.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 		 889 aa  78.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  24.46 
 
 		 587 aa  78.2  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.2 
 
 		 786 aa  77.8  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  24.34 
 
 		 578 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1152 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1150 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  41.74 
 
 		 563 aa  74.7  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 591 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 591 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 591 aa  74.3  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.38 
 
 		 557 aa  73.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.74 
 
 		 593 aa  73.9  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  29.39 
 
 		 540 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.7 
 
 		 623 aa  73.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6532  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.49 
 
 		 562 aa  72.8  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.54 
 
 		 1152 aa  72  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.78 
 
 		 586 aa  70.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.37 
 
 		 1132 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.08 
 
 		 583 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  26.98 
 
 		 632 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  27.27 
 
 		 653 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4226  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.21 
 
 		 546 aa  68.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130746  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  28.14 
 
 		 632 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  27.84 
 
 		 632 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  28.14 
 
 		 632 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  26.98 
 
 		 632 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  26.98 
 
 		 552 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 578 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  27.99 
 
 		 696 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 		 578 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.65 
 
 		 570 aa  64.3  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  40.38 
 
 		 567 aa  62  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0628  FAD dependent oxidoreductase  38.26 
 
 		 556 aa  61.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.3 
 
 		 552 aa  60.1  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  36.56 
 
 		 551 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 		 581 aa  59.3  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3364  hypothetical protein  30.38 
 
 		 738 aa  58.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451115  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  37.12 
 
 		 577 aa  58.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.48 
 
 		 550 aa  57.4  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 567 aa  57.4  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  51.67 
 
 		 577 aa  57  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000517221  hitchhiker  0.0000805295 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.92 
 
 		 582 aa  55.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.71 
 
 		 535 aa  55.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 657 aa  54.3  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0318  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.75 
 
 		 537 aa  53.9  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.02 
 
 		 565 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  32.43 
 
 		 562 aa  49.7  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.633158  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3808  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.01 
 
 		 547 aa  48.9  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.605068  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 489 aa  48.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.42 
 
 		 1150 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  26.27 
 
 		 549 aa  47.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3166  putative dehydrogenase transmembrane protein  41.67 
 
 		 506 aa  44.3  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  36.92 
 
 		 521 aa  43.9  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2044  GMC family oxidoreductase  46.51 
 
 		 494 aa  43.9  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>