145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4092 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  61.1 
 
 
695 aa  748    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  58.62 
 
 
692 aa  694    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  56.24 
 
 
645 aa  681    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  60.66 
 
 
680 aa  754    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  100 
 
 
670 aa  1315    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  54.3 
 
 
679 aa  614  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  53.02 
 
 
666 aa  581  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  54.79 
 
 
659 aa  571  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  49.01 
 
 
719 aa  569  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  49.84 
 
 
672 aa  537  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  48.15 
 
 
727 aa  523  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  48.09 
 
 
717 aa  498  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  46.95 
 
 
695 aa  488  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  44.38 
 
 
792 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  46.38 
 
 
684 aa  441  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.26 
 
 
710 aa  332  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.98 
 
 
741 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  32.32 
 
 
1048 aa  252  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.38 
 
 
732 aa  245  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  31.15 
 
 
759 aa  238  3e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  30.74 
 
 
758 aa  237  4e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  33.19 
 
 
706 aa  237  5.0000000000000005e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  33.96 
 
 
750 aa  230  6e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.49 
 
 
861 aa  230  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.42 
 
 
693 aa  225  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.78 
 
 
705 aa  219  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.4 
 
 
724 aa  210  7e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  32.33 
 
 
703 aa  209  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  30.64 
 
 
742 aa  209  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.12 
 
 
747 aa  206  8e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  31.05 
 
 
726 aa  206  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.24 
 
 
691 aa  206  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  30.56 
 
 
742 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  26.03 
 
 
691 aa  200  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  26.5 
 
 
689 aa  199  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  26.81 
 
 
689 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  26.35 
 
 
689 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  26.81 
 
 
689 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  26.07 
 
 
691 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  26.47 
 
 
691 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  33.1 
 
 
706 aa  198  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  26.31 
 
 
689 aa  198  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  36.77 
 
 
829 aa  197  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  26.15 
 
 
689 aa  196  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  35.54 
 
 
734 aa  194  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  33.03 
 
 
705 aa  192  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  26.35 
 
 
689 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.26 
 
 
813 aa  191  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  40.41 
 
 
726 aa  189  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  40.2 
 
 
776 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  39.8 
 
 
757 aa  189  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  37.34 
 
 
759 aa  186  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.54 
 
 
788 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.38 
 
 
733 aa  183  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  36.72 
 
 
874 aa  182  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.02 
 
 
767 aa  182  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.97 
 
 
766 aa  181  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.17 
 
 
748 aa  180  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  27.43 
 
 
702 aa  178  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.13 
 
 
746 aa  178  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  37.93 
 
 
754 aa  178  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  34.77 
 
 
724 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  35.45 
 
 
724 aa  177  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  35.45 
 
 
724 aa  177  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  23.34 
 
 
760 aa  177  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.94 
 
 
758 aa  176  9e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  28.03 
 
 
712 aa  176  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.32 
 
 
804 aa  176  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  22.28 
 
 
763 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  25 
 
 
706 aa  174  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  36.12 
 
 
771 aa  174  6.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  24.85 
 
 
706 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  46.78 
 
 
799 aa  171  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  38.99 
 
 
765 aa  166  9e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  34.5 
 
 
795 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.85 
 
 
755 aa  165  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  39.79 
 
 
902 aa  161  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  42.86 
 
 
832 aa  160  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  44.77 
 
 
685 aa  154  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  43.59 
 
 
786 aa  153  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  30.71 
 
 
761 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  25.52 
 
 
762 aa  149  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  28.19 
 
 
717 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  26.46 
 
 
715 aa  147  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  29.61 
 
 
716 aa  144  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  23.08 
 
 
702 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  37.75 
 
 
742 aa  138  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  23.78 
 
 
748 aa  138  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.01 
 
 
732 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.02 
 
 
764 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  33.01 
 
 
755 aa  128  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  34.52 
 
 
753 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  34.1 
 
 
776 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  34.1 
 
 
777 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1118  helicase, UvrD/Rep family  34.1 
 
 
776 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0603205 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  34.1 
 
 
776 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  34.1 
 
 
776 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.02 
 
 
763 aa  125  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  34.1 
 
 
777 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  33.64 
 
 
778 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>