69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4088 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  100 
 
 		 213 aa  424  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  56.52 
 
 		 180 aa  205  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.5 
 
 		 243 aa  114  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  39.67 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  33.5 
 
 		 232 aa  98.6  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  38.6 
 
 		 192 aa  95.5  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  37.57 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  37.24 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  32.64 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  35.83 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.2 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 192 aa  85.9  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  37.04 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  36.11 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  53.25 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  37.27 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  31.55 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  32.23 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  30.73 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  41.23 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  36.26 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  34.52 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  44.74 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  39 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  56.1 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  32.77 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  31.89 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  36.7 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2853  putative transcriptional regulator  36.05 
 
 		 193 aa  51.6  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  decreased coverage  0.00327558 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2808  transcriptional regulator, ArsR family  43.02 
 
 		 101 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.598578  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  41.46 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05590  hypothetical protein  25.9 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604639  normal  0.83451 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2299  regulatory protein, ArsR  30.17 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.718193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  30.3 
 
 		 171 aa  48.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  43.1 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  34.21 
 
 		 120 aa  46.2  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2627  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 102 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.8267  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2507  regulatory protein ArsR  41.67 
 
 		 120 aa  45.8  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238206 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  40.26 
 
 		 135 aa  45.4  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2713  transcriptional regulator, ArsR family  48.15 
 
 		 102 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2878  transcriptional regulator, MarR family  44.62 
 
 		 112 aa  45.4  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  35.87 
 
 		 125 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  42.37 
 
 		 129 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2299  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 115 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0328  putative transcriptional regulator  34.62 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 98 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 112 aa  43.9  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 107 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2592  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 		 123 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.108396 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1905  putative transcriptional regulator  37.35 
 
 		 176 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0592557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 125 aa  42.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  29.41 
 
 		 336 aa  42.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 120 aa  42.4  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  41.67 
 
 		 113 aa  42  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2886  transcriptional regulator, TrmB  35.09 
 
 		 114 aa  42  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  36.25 
 
 		 127 aa  41.6  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 		 124 aa  41.6  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>