More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4060 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  38.01 
 
 		 1008 aa  666    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  53.98 
 
 		 1117 aa  1107    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  42.64 
 
 		 1069 aa  723    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  52.63 
 
 		 1104 aa  1085    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  100 
 
 		 1059 aa  2133    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  55.74 
 
 		 1089 aa  1159    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  42.76 
 
 		 1016 aa  766    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  40.04 
 
 		 1051 aa  673    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.665877 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  37.09 
 
 		 1181 aa  640    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  43.63 
 
 		 1065 aa  923    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  35.54 
 
 		 1147 aa  593  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  36.87 
 
 		 1107 aa  587  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  33.22 
 
 		 1186 aa  558  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  31.22 
 
 		 1354 aa  491  1e-137  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  31.71 
 
 		 1167 aa  476  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  39.2 
 
 		 1183 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  30.36 
 
 		 1075 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  31.84 
 
 		 1084 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  29.96 
 
 		 1079 aa  446  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  30.08 
 
 		 1092 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  30.86 
 
 		 1104 aa  433  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  30.43 
 
 		 1094 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  30.44 
 
 		 1093 aa  429  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  30.02 
 
 		 1094 aa  426  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  30.02 
 
 		 1094 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  30.24 
 
 		 1094 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  30.34 
 
 		 1094 aa  426  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  30.25 
 
 		 1093 aa  425  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  30.35 
 
 		 1093 aa  426  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  30.28 
 
 		 1094 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  29.15 
 
 		 1094 aa  415  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  29.21 
 
 		 1094 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  29.1 
 
 		 1097 aa  405  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  29.14 
 
 		 1090 aa  321  5e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  29.97 
 
 		 1067 aa  320  1e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  28.47 
 
 		 1082 aa  306  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  23.66 
 
 		 1097 aa  201  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  25.76 
 
 		 1125 aa  192  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  23.09 
 
 		 1084 aa  189  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  28.9 
 
 		 1193 aa  185  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  29.82 
 
 		 1545 aa  161  7e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  29.65 
 
 		 1545 aa  160  8e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26649  predicted protein  27.25 
 
 		 1484 aa  110  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  25.65 
 
 		 427 aa  101  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  25.81 
 
 		 425 aa  100  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  24.57 
 
 		 1076 aa  100  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  24.94 
 
 		 428 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  27.3 
 
 		 432 aa  91.7  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  26.28 
 
 		 457 aa  87  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  25.81 
 
 		 465 aa  84.7  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  25.49 
 
 		 482 aa  77.4  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  25.45 
 
 		 483 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  27.05 
 
 		 484 aa  68.2  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  23.87 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  23.74 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  23.74 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4927  peptidase S41  29.41 
 
 		 416 aa  64.3  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.966695 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  22.52 
 
 		 418 aa  63.2  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  23.32 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0838  Periplasmic protease-like protein  27.09 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  24.07 
 
 		 1081 aa  62  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3088  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.34 
 
 		 661 aa  62  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350788 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  27.53 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  22.41 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  22.94 
 
 		 1066 aa  60.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1027  peptidase S41  25.47 
 
 		 509 aa  60.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0560517  normal  0.0627841 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  34.62 
 
 		 434 aa  59.7  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  33.61 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  31.53 
 
 		 1062 aa  59.3  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  29.3 
 
 		 567 aa  59.3  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  34.62 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  25.55 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  31.53 
 
 		 1062 aa  58.9  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  31.53 
 
 		 1062 aa  58.9  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  34.88 
 
 		 1071 aa  58.5  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  31.53 
 
 		 1062 aa  58.5  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  30.34 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  35.58 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  32.46 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  34.62 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  30.63 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  22.16 
 
 		 1067 aa  58.2  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  23.12 
 
 		 389 aa  57.4  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  34.07 
 
 		 1069 aa  57.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  34.83 
 
 		 1062 aa  57.4  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  34.07 
 
 		 1060 aa  57.4  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  34.83 
 
 		 1062 aa  57.4  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  33.71 
 
 		 1049 aa  57.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  31.09 
 
 		 445 aa  56.6  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  20.83 
 
 		 416 aa  57  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  22.88 
 
 		 535 aa  56.6  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  30.77 
 
 		 316 aa  57  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.98 
 
 		 407 aa  56.2  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  30.63 
 
 		 1065 aa  56.2  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4234  transcriptional regulatory protein-like  26.67 
 
 		 469 aa  56.2  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  30.25 
 
 		 441 aa  56.2  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  28.83 
 
 		 1062 aa  56.2  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  22 
 
 		 1005 aa  56.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  24.22 
 
 		 428 aa  55.8  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  28.57 
 
 		 1084 aa  55.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>