54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4041 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4041  hydantoinase  100 
 
 		 374 aa  711    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711164  decreased coverage  0.0015292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3366  N-methylhydantoinase A, beta-subunit (ATP- hydrolyzing)  35.45 
 
 		 507 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.712496  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0095  hydantoinase/oxoprolinase  31.52 
 
 		 517 aa  110  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2141  Hydantoinase/oxoprolinase  33.2 
 
 		 519 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0427  hydantoinase/oxoprolinase  33.95 
 
 		 519 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0645976  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22890  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  32.2 
 
 		 515 aa  107  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.700503 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2949  hydantoinase/oxoprolinase  36.36 
 
 		 519 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1825  hydantoinase/oxoprolinase  30.99 
 
 		 523 aa  104  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1963  hydantoinase/oxoprolinase  28.66 
 
 		 516 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  28.76 
 
 		 515 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2452  Hydantoinase/oxoprolinase  32.23 
 
 		 513 aa  100  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.79439  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4112  hydantoinase/oxoprolinase  27.14 
 
 		 538 aa  100  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4083  hydantoinase/oxoprolinase  36.33 
 
 		 517 aa  99.4  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0965914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4110  Hydantoinase/oxoprolinase  31.55 
 
 		 522 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.571056  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3586  Hydantoinase/oxoprolinase  28.78 
 
 		 519 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0167077  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3064  Hydantoinase/oxoprolinase  31.76 
 
 		 526 aa  97.1  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3583  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  27.03 
 
 		 463 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1851  hydantoinase/oxoprolinase  33.95 
 
 		 518 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51976  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3646  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase beta subunit-like protein  29.14 
 
 		 439 aa  90.5  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2416  putative hydantoinase A  31.6 
 
 		 517 aa  90.1  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1995  Hydantoinase/oxoprolinase  32.39 
 
 		 522 aa  89  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1727  Hydantoinase/oxoprolinase  30.37 
 
 		 522 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.666608  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4116  Hydantoinase/oxoprolinase  35.68 
 
 		 519 aa  86.7  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0652  Hydantoinase/oxoprolinase  28.88 
 
 		 516 aa  84.7  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0481682 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0865  Hydantoinase/oxoprolinase  29.11 
 
 		 518 aa  84  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3368  hydantoinase  34.58 
 
 		 464 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00437315  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4196  hydantoinase/oxoprolinase  33.18 
 
 		 521 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179631  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5378  hydantoinase  30.33 
 
 		 517 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2206  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  30.56 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00953084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  24.88 
 
 		 983 aa  69.7  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  26.26 
 
 		 999 aa  68.9  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1068  hydantoinase  26.4 
 
 		 642 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  27.55 
 
 		 994 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0899  hydantoinase/oxoprolinase  28.25 
 
 		 643 aa  56.2  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.742994  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2491  hydantoinase  28.39 
 
 		 701 aa  56.2  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0079  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.16 
 
 		 687 aa  53.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1967  hydantoinase/oxoprolinase  28.81 
 
 		 639 aa  53.9  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1734  Hydantoinase/oxoprolinase  26.67 
 
 		 658 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1134  hydantoinase/oxoprolinase  25.99 
 
 		 645 aa  50.4  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.187357  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2805  hydantoinase/oxoprolinase  30.11 
 
 		 668 aa  49.7  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5220  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.72 
 
 		 680 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46382  normal  0.858688 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2490  hydantoinase  26.97 
 
 		 636 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20940  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  28.08 
 
 		 706 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796393  normal  0.0791884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.92 
 
 		 681 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6595  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.71 
 
 		 674 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0124  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.83 
 
 		 690 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256267  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5632  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.35 
 
 		 698 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0796839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.37 
 
 		 681 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1067  hydantoinase  29.61 
 
 		 671 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2447  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.07 
 
 		 683 aa  43.9  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  28.34 
 
 		 676 aa  43.5  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3529  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28 
 
 		 694 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1876  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.52 
 
 		 690 aa  43.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.41 
 
 		 694 aa  42.7  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>