20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3923 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3923  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  276  8e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119406  decreased coverage  0.00597108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2565  hypothetical protein  53.62 
 
 		 139 aa  147  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480813  normal  0.623984 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0862  hypothetical protein  48.51 
 
 		 133 aa  111  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6479  hypothetical protein  42.11 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336696  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0334  hypothetical protein  41.67 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4654  hypothetical protein  41.22 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3417  hypothetical protein  46.91 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1755  hypothetical protein  37.41 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.503143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1741  hypothetical protein  35.25 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.17945  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1115  hypothetical protein  33.58 
 
 		 536 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1780  hypothetical protein  35.85 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08420  hypothetical protein  46.43 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1255  hypothetical protein  28.57 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0534  hypothetical protein  38 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0177  hypothetical protein  36 
 
 		 75 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2095  hypothetical protein  32 
 
 		 62 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2094  hypothetical protein  32 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3607  hypothetical protein  34.62 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3285  hypothetical protein  34.62 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1647  hypothetical protein  32 
 
 		 75 aa  40  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>