248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3696 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 
181 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  72.88 
 
 
178 aa  268  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  61.26 
 
 
192 aa  243  9e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  61.11 
 
 
183 aa  212  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  52.17 
 
 
203 aa  190  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  51.4 
 
 
182 aa  187  8e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  50.83 
 
 
199 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45.51 
 
 
180 aa  159  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  44.63 
 
 
181 aa  157  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  47.46 
 
 
179 aa  153  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  41.81 
 
 
181 aa  149  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  44.94 
 
 
180 aa  145  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.62 
 
 
201 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.41 
 
 
204 aa  141  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  44.63 
 
 
187 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  40.44 
 
 
204 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  43.68 
 
 
178 aa  136  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  41.57 
 
 
183 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.81 
 
 
183 aa  134  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5654  hypothetical protein  77.27 
 
 
122 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316423  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.25 
 
 
188 aa  132  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  40.41 
 
 
200 aa  132  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  43.51 
 
 
178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40 
 
 
181 aa  128  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.1 
 
 
221 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  39.44 
 
 
178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.18 
 
 
183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.32 
 
 
217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.66 
 
 
187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  36 
 
 
228 aa  124  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  37.16 
 
 
215 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.67 
 
 
204 aa  121  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.36 
 
 
185 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.79 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0509  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.89 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  decreased coverage  0.000000276564 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.17 
 
 
212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.67 
 
 
187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.84 
 
 
196 aa  118  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  38.02 
 
 
219 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.67 
 
 
186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  39.75 
 
 
221 aa  118  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  37.17 
 
 
221 aa  117  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.12 
 
 
204 aa  117  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.75 
 
 
201 aa  116  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.79 
 
 
221 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  37.17 
 
 
203 aa  115  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.72 
 
 
187 aa  114  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.25 
 
 
221 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.8 
 
 
201 aa  114  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.14 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  36.87 
 
 
183 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.72 
 
 
178 aa  111  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  37.7 
 
 
198 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  38.82 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  39.66 
 
 
177 aa  107  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.83 
 
 
199 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.46 
 
 
177 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.39 
 
 
178 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.86 
 
 
176 aa  105  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
204 aa  104  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.04 
 
 
200 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.33 
 
 
180 aa  103  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.78 
 
 
178 aa  102  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.33 
 
 
188 aa  102  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  32.46 
 
 
218 aa  102  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.3 
 
 
188 aa  101  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  35.79 
 
 
200 aa  101  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  37.95 
 
 
205 aa  100  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  34.84 
 
 
183 aa  100  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.71 
 
 
224 aa  99.8  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.16 
 
 
189 aa  99.4  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  40.13 
 
 
181 aa  99.8  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.12 
 
 
210 aa  98.6  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.88 
 
 
209 aa  98.2  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.03 
 
 
181 aa  98.2  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  32.6 
 
 
180 aa  97.8  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.53 
 
 
185 aa  97.1  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.15 
 
 
192 aa  96.3  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  33.33 
 
 
185 aa  95.5  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  34.72 
 
 
199 aa  95.1  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21110  dihydrofolate reductase  34.25 
 
 
208 aa  94.4  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.540595  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  32.42 
 
 
181 aa  94.4  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.13 
 
 
208 aa  93.6  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  34.3 
 
 
179 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.32 
 
 
190 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.27 
 
 
209 aa  92  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  39.6 
 
 
188 aa  91.7  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3213  putative secreted protein  46.94 
 
 
98 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.82639  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3631  deaminase-reductase domain-containing protein  37.35 
 
 
205 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.05 
 
 
217 aa  91.3  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  37.24 
 
 
167 aa  91.3  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  34.05 
 
 
217 aa  91.3  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0067  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.04 
 
 
157 aa  91.3  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.482424  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  34.57 
 
 
187 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  35.4 
 
 
214 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  31.77 
 
 
208 aa  90.5  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2667  deaminase-reductase domain-containing protein  33.51 
 
 
217 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.57 
 
 
188 aa  90.1  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.78 
 
 
202 aa  89.4  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.05 
 
 
183 aa  89  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>