59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3616 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3616  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  211  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4724  hypothetical protein  85.57 
 
 		 97 aa  163  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2304  hypothetical protein  74.23 
 
 		 97 aa  147  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2667  protein of unknown function DUF1330  72.16 
 
 		 97 aa  141  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2987  protein of unknown function DUF1330  72.45 
 
 		 98 aa  129  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1007  protein of unknown function DUF1330  57.29 
 
 		 96 aa  104  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7205  protein of unknown function DUF1330  50.52 
 
 		 97 aa  94.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2189  protein of unknown function DUF1330  51.58 
 
 		 96 aa  94  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.321653  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4093  hypothetical protein  48.45 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0417  hypothetical protein  52.58 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  45.83 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  41.49 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  43.75 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  39.36 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  42.11 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  40 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2998  hypothetical protein  55.93 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0574194 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0599  hypothetical protein  40.45 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.543167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  37.5 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1937  hypothetical protein  42.71 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0325431 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1707  hypothetical protein  41.84 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  36.08 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1988  hypothetical protein  33.68 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  36.08 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1233  hypothetical protein  41.1 
 
 		 95 aa  50.4  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.346444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  43.04 
 
 		 112 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  36.08 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  37.11 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2371  hypothetical protein  39.18 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.762767  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  39.24 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2103  hypothetical protein  38.14 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.40869  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0450  hypothetical protein  38.14 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  31.96 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2483  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  30.93 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0386  hypothetical protein  34.02 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  34.38 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  31.25 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  34.74 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  37.21 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  31.25 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  37.5 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  32.99 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  34.38 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0008  hypothetical protein  34.74 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00922624  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  32.99 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  34.69 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1641  hypothetical protein  31.18 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825876  hitchhiker  0.000000345307 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0434  hypothetical protein  32.99 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0341  protein of unknown function DUF1330  32.99 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00521106  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  30.93 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  32.99 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1754  hypothetical protein  32.99 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  35.29 
 
 		 96 aa  42  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  32.47 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  39.71 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  32.99 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1519  protein of unknown function DUF1330  38.14 
 
 		 114 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.407227 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  31.25 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>