38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3607 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3607  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  150  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9020  hypothetical protein  73.24 
 
 		 74 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0873  hypothetical protein  64.79 
 
 		 74 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23290  hypothetical protein  56.16 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4114  hypothetical protein  56.16 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316691  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4100  hypothetical protein  55.41 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1979  Protein of unknown function DUF2277  50.7 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.367079  normal  0.383603 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3874  hypothetical protein  55.41 
 
 		 90 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2050  hypothetical protein  52.11 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1346  hypothetical protein  52.11 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.093057  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5022  hypothetical protein  50.7 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5849  hypothetical protein  50.67 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.449702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1700  hypothetical protein  52.17 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00489273  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2124  hypothetical protein  53.42 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0806106  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12900  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6235  hypothetical protein  52.78 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2423  hypothetical protein  46.48 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1784  hypothetical protein  47.89 
 
 		 95 aa  63.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.672512 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1500  Protein of unknown function DUF2277  43.66 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036571 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3498  Protein of unknown function DUF2277  48.65 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0782  hypothetical protein  47.95 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1627  hypothetical protein  50.72 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0246366  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2833  hypothetical protein  47.83 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6437  hypothetical protein  43.66 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.175327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0012  hypothetical protein  43.66 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000302425 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1521  hypothetical protein  53.03 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0150992  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1936  hypothetical protein  52.11 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1959  hypothetical protein  39.44 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.655649  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3637  Protein of unknown function DUF2277  52.11 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1910  Protein of unknown function DUF2277  44.44 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1878  hypothetical protein  42.67 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2072  hypothetical protein  48.57 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00877589  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2135  hypothetical protein  48.57 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0178676 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2089  hypothetical protein  48.57 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0703  hypothetical protein  53.52 
 
 		 90 aa  42.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.394732  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1986  hypothetical protein  45.83 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.664421  normal  0.484535 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12843  hypothetical protein  47.3 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3867  Protein of unknown function DUF2277  53.66 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>